More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2323 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
464 aa  929    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.73 
 
 
464 aa  837    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  59 
 
 
467 aa  542  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.66 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.09 
 
 
619 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.75 
 
 
467 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.43 
 
 
625 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
467 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
467 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.78 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.25 
 
 
467 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.66 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.45 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.78 
 
 
463 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.29 
 
 
470 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.66 
 
 
484 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.2 
 
 
470 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.46 
 
 
465 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.57 
 
 
463 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.85 
 
 
466 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.34 
 
 
465 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.9 
 
 
468 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.84 
 
 
581 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.55 
 
 
470 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.58 
 
 
680 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.94 
 
 
468 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.77 
 
 
470 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.68 
 
 
468 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
470 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
470 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.47 
 
 
468 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
470 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.44 
 
 
474 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
470 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.82 
 
 
607 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.02 
 
 
470 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.11 
 
 
464 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.22 
 
 
462 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.91 
 
 
463 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.62 
 
 
465 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 
468 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.47 
 
 
470 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.02 
 
 
469 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  47 
 
 
466 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.11 
 
 
467 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.07 
 
 
467 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.79 
 
 
466 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.4 
 
 
481 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.9 
 
 
467 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.87 
 
 
466 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 
476 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 
476 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 
476 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.51 
 
 
476 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.84 
 
 
467 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.84 
 
 
467 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.42 
 
 
475 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
476 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.35 
 
 
467 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.98 
 
 
478 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
476 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.99 
 
 
603 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.18 
 
 
468 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
476 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.55 
 
 
462 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 
476 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.21 
 
 
476 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
476 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  47.92 
 
 
474 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
476 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  44.42 
 
 
466 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
476 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.63 
 
 
467 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.77 
 
 
603 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.86 
 
 
476 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.42 
 
 
467 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.92 
 
 
474 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
476 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.28 
 
 
471 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  46.85 
 
 
464 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
476 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  46.58 
 
 
474 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  46.36 
 
 
474 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  45.4 
 
 
500 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.58 
 
 
476 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.56 
 
 
466 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.48 
 
 
594 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.92 
 
 
593 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.84 
 
 
467 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 
480 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.42 
 
 
480 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 
474 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
476 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 
478 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.41 
 
 
602 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>