More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2305 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  259  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  81.54 
 
 		 130 aa  218  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 256 aa  62  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.9 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 505 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  39.51 
 
 		 255 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  32.23 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 211 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4921  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 260 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320603  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 255 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 209 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 191 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  40.91 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 195 aa  50.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 178 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.67 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  29.67 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 490 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  29.67 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  33.7 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  36.25 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  32.17 
 
 		 233 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  35 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  34.48 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  34.48 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  34.48 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  41.94 
 
 		 489 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 207 aa  47.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 496 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>