130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2198 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  261  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  59.48 
 
 
123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  36.19 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  37.76 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  42.86 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  38.21 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  37.86 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  37.86 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  37.86 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  34.82 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  35.64 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  37.76 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  36.44 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  36.73 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  35.71 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  35.71 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  37.62 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  36.36 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  35.19 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  35.71 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  35.71 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  31.73 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  34.85 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  34.85 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  37.5 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  38.78 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  37.5 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  37.5 
 
 
172 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  38.1 
 
 
150 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  35.78 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  35.11 
 
 
185 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  34.34 
 
 
228 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  34.82 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  38.46 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  36.52 
 
 
164 aa  57  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  28.16 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30.1 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  34.55 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  34.04 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  34.41 
 
 
196 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  32.99 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  34.65 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  29.29 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  27.35 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  36.84 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  30.36 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  34.26 
 
 
161 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  34.38 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  37.93 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  32.17 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  29.91 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  34.29 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  26.4 
 
 
135 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  31.19 
 
 
134 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  29.13 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  29.13 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  29.13 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  27.27 
 
 
202 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  28.15 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  30.56 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  31 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  28.16 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  32.61 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  41.56 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  23.48 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  32 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  31.87 
 
 
184 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  31.15 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  33.02 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  32.11 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  31.86 
 
 
218 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  25.83 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  26.02 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  26.27 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  25.96 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  31.5 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  29.75 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  26.92 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  28.87 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  28.16 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  27.34 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  27.34 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  26.27 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  35.8 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  29.29 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  29.29 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  30.33 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  31.52 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  30.33 
 
 
269 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  30.09 
 
 
267 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  29.67 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  27.05 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  29.55 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>