More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2129 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  100 
 
 
225 aa  451  1e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  72.44 
 
 
225 aa  335  3e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.52 
 
 
219 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.09 
 
 
224 aa  136  3e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 
231 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
225 aa  134  1e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.89 
 
 
225 aa  133  2e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.14 
 
 
225 aa  130  2e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  40 
 
 
228 aa  128  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.51 
 
 
243 aa  127  1e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 
228 aa  127  2e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  38.99 
 
 
224 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  39.8 
 
 
225 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.5 
 
 
228 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
227 aa  124  8e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.09 
 
 
226 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.24 
 
 
224 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  35.65 
 
 
225 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.78 
 
 
226 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.39 
 
 
225 aa  120  1e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.55 
 
 
226 aa  121  1e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.63 
 
 
242 aa  121  1e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  37.24 
 
 
225 aa  120  1e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  39.18 
 
 
224 aa  120  2e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  37.21 
 
 
224 aa  120  2e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
232 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.14 
 
 
224 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  42.94 
 
 
226 aa  119  4e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 
225 aa  119  5e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  35.65 
 
 
225 aa  118  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.23 
 
 
220 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
224 aa  118  8e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.32 
 
 
224 aa  118  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.75 
 
 
224 aa  117  1e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.2 
 
 
224 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
226 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
234 aa  115  4e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
224 aa  115  8e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
228 aa  114  9e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
224 aa  114  1e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
224 aa  114  2e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
224 aa  114  2e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
224 aa  114  2e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.79 
 
 
232 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.8 
 
 
227 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.75 
 
 
236 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
234 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
224 aa  111  7e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  111  7e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
222 aa  111  7e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
225 aa  111  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
252 aa  110  2e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
218 aa  110  2e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.85636e-06  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
228 aa  110  2e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  8.36213e-06 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  35.58 
 
 
220 aa  110  2e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
225 aa  110  2e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
249 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.65 
 
 
223 aa  109  4e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
225 aa  109  4e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  32.72 
 
 
222 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.51 
 
 
232 aa  108  7e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  37.21 
 
 
225 aa  108  7e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
225 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  9.29699e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
226 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.99 
 
 
230 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.11 
 
 
236 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
226 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
225 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  30.37 
 
 
243 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
226 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  36.46 
 
 
214 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  34.34 
 
 
198 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 
229 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  34.16 
 
 
214 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
231 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
228 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  33.51 
 
 
214 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
235 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.38682e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
226 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  36.46 
 
 
223 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  36.46 
 
 
214 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  34.67 
 
 
211 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  36.46 
 
 
214 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  34.27 
 
 
217 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  29.38 
 
 
267 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.39 
 
 
225 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  35.15 
 
 
215 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  36.26 
 
 
214 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.66 
 
 
227 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
241 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  34.65 
 
 
214 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
222 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
227 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.86 
 
 
212 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  35.15 
 
 
214 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  33.52 
 
 
212 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.41 
 
 
231 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.3 
 
 
229 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.45 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>