More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2089 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
293 aa  578  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.40561e-07  normal  0.90976 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.07 
 
 
320 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  53.42 
 
 
325 aa  316  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  53.42 
 
 
325 aa  315  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.48 
 
 
312 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.82 
 
 
328 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 
328 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.86 
 
 
300 aa  294  9e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  3.78352e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.16 
 
 
324 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.96 
 
 
295 aa  293  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.67 
 
 
320 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
304 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.16 
 
 
293 aa  278  9e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.16 
 
 
293 aa  278  9e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.18 
 
 
320 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.25 
 
 
315 aa  275  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.91 
 
 
293 aa  275  5e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.25 
 
 
330 aa  272  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.37 
 
 
303 aa  271  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.236219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0761  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.45 
 
 
320 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0629996  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.84 
 
 
297 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0888  sugar ABC transporter, permease protein  49.14 
 
 
320 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.96 
 
 
307 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.86 
 
 
306 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
296 aa  231  7e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05438e-20 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.39 
 
 
435 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.96 
 
 
299 aa  221  1e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.7 
 
 
357 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  45.08 
 
 
292 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
310 aa  213  3e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
427 aa  212  6e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.29291e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
355 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
301 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
309 aa  200  2e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
318 aa  199  4e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
312 aa  196  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
330 aa  196  5e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
299 aa  195  8e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.28 
 
 
304 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
319 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
299 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.610005  normal  0.71076 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
315 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
315 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
262 aa  183  2e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
309 aa  184  2e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
388 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  39.24 
 
 
292 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
294 aa  181  9e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
308 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
308 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.853442  normal  0.685254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11261  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugA  41.24 
 
 
307 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00812399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
291 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
308 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172958  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
291 aa  179  3e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.476032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.51 
 
 
331 aa  179  3e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  36 
 
 
318 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.75 
 
 
321 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
310 aa  179  5e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
307 aa  179  5e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
296 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
304 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.707606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
338 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0789775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
296 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
285 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00879782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
345 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.65014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
310 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
323 aa  175  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
307 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
310 aa  175  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
290 aa  174  2e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000136101  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
308 aa  173  3e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
291 aa  173  3e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.65 
 
 
308 aa  172  4e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1088  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.89 
 
 
288 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  hitchhiker  0.00755847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
320 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
295 aa  168  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
294 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288658  normal  0.0756683 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
315 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0566045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04590  permease component of ABC-type sugar transporter  39.51 
 
 
323 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
313 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  36.47 
 
 
312 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
324 aa  164  1e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
312 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
286 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.08841e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
319 aa  163  4e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
295 aa  162  4e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
324 aa  162  5e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
294 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0749  sugar ABC transporter, permease protein, putative  33.1 
 
 
289 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
289 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  37.12 
 
 
312 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
313 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
292 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0233696  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
325 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
291 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
294 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.46 
 
 
318 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>