More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2053 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  79.65 
 
 		 405 aa  674    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 406 aa  834    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  52.42 
 
 		 405 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  52.42 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 409 aa  315  7e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  43.75 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  43.41 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  43.41 
 
 		 399 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  36.74 
 
 		 396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  36.59 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  36.89 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  36.65 
 
 		 406 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  36.14 
 
 		 402 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  35.98 
 
 		 403 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  36.18 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  35.34 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  35.09 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  35.26 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 		 412 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 407 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  34.51 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  37.91 
 
 		 625 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  33.41 
 
 		 397 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 		 394 aa  199  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  36.27 
 
 		 399 aa  199  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  33.65 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  36.92 
 
 		 390 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  32.9 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  34.84 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  32.91 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  32.9 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 400 aa  189  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  33.5 
 
 		 400 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  32.5 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  34.8 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  31.96 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  32.5 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  34.8 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  34.56 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  34.56 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  34.56 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.72 
 
 		 396 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  34.56 
 
 		 422 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  31.9 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  32.68 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 406 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  33.83 
 
 		 398 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  34.07 
 
 		 422 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  38.56 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  33.09 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  35.44 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  33.33 
 
 		 422 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  35.73 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  32.27 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  32.27 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 		 396 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  31.86 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  35.14 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  32.02 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  32.02 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  32.02 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  30.02 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  32.47 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  31.95 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 437 aa  159  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  32.18 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  31.07 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 369 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.75 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.55 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  35.38 
 
 		 371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.55 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.55 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.55 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.55 
 
 		 373 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 373 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 373 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>