234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2048 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  93.7 
 
 
254 aa  485  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  55.34 
 
 
254 aa  293  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  51.57 
 
 
262 aa  291  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  54.33 
 
 
264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  53.54 
 
 
255 aa  288  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  54.33 
 
 
255 aa  286  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  50.59 
 
 
255 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  50 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  52.16 
 
 
255 aa  281  6.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  51.97 
 
 
254 aa  278  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  51.78 
 
 
257 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  53.15 
 
 
255 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  50.2 
 
 
263 aa  272  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  55.95 
 
 
262 aa  271  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000054908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  52.57 
 
 
254 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  48.82 
 
 
269 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  51.57 
 
 
255 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  50 
 
 
255 aa  268  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  49.41 
 
 
258 aa  267  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  48.22 
 
 
263 aa  265  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  49.41 
 
 
258 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  49.61 
 
 
256 aa  262  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  47.83 
 
 
262 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  51.18 
 
 
254 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  53.15 
 
 
254 aa  260  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  47.43 
 
 
262 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  47.43 
 
 
262 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  47.43 
 
 
262 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  47.43 
 
 
262 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  48.22 
 
 
262 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  47.83 
 
 
262 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  47.43 
 
 
262 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  47.43 
 
 
262 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  47.43 
 
 
262 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  47.73 
 
 
274 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  48.62 
 
 
258 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  47.29 
 
 
259 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  47.29 
 
 
259 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  47.04 
 
 
262 aa  258  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  49.61 
 
 
254 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  48.06 
 
 
264 aa  255  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  49.61 
 
 
254 aa  254  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  50.39 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  47.45 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  50.99 
 
 
258 aa  252  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  50.2 
 
 
255 aa  248  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  52.36 
 
 
254 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  52.76 
 
 
254 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  52.76 
 
 
254 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  52.76 
 
 
254 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  47.24 
 
 
255 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  49.6 
 
 
261 aa  238  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.64 
 
 
262 aa  237  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  43.68 
 
 
263 aa  236  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  47.29 
 
 
262 aa  234  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  45.77 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  46.59 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  43.97 
 
 
258 aa  228  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  43.41 
 
 
260 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  43.36 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  45.49 
 
 
257 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  48 
 
 
255 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  44.49 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  43.92 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  42.86 
 
 
264 aa  214  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  44.71 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  46.06 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  44.09 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  45.28 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  43.02 
 
 
260 aa  211  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.91 
 
 
253 aa  209  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1907  putative transcriptional acitvator, Baf family  48.28 
 
 
270 aa  209  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  42.35 
 
 
261 aa  204  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  44.09 
 
 
260 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0920  pantothenate kinase  41.34 
 
 
256 aa  204  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  44.71 
 
 
257 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  44.7 
 
 
261 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  44.49 
 
 
254 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  44.31 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  44.31 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  45.1 
 
 
260 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  42.25 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4713  Baf family transcriptional activator  44.49 
 
 
252 aa  195  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.073438  hitchhiker  0.000383315 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2865  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.75 
 
 
260 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  38.58 
 
 
259 aa  191  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  42.02 
 
 
259 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  44.66 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1063  pantothenate kinase  37.15 
 
 
255 aa  189  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  39.44 
 
 
257 aa  186  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1331  pantothenate kinase  41.18 
 
 
256 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181075  normal  0.0140716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  36.47 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  41.86 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  38.28 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  40.77 
 
 
266 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1198  pantothenate kinase  41.63 
 
 
259 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  39.85 
 
 
285 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  36.33 
 
 
256 aa  174  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.73 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>