More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2021 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 
266 aa  546  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  71.8 
 
 
266 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  64.11 
 
 
267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2269  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
278 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3122  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.76 
 
 
278 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.38 
 
 
278 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0511045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3145  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.38 
 
 
278 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3085  glycosyl transferase, group 2 family protein  41 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2193  glycosyl transferase, group 2 family protein  41 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2066  glycosyl transferase, group 2 family protein  41 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0714  glycosyl transferase, group 2 family protein  41 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2548  glycosyl transferase, group 2 family protein  41 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0918  glycosyl transferase family 2  40.23 
 
 
276 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3703  putative glycosyl transferase  40.23 
 
 
276 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0781  glycosyl transferase family protein  37.69 
 
 
274 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0770  glycosyl transferase family protein  37.69 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2499  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
274 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0861  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
274 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0412  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
274 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0891  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
274 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0211715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3988  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10621 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
347 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
321 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
306 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  31.84 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
361 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.6 
 
 
367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
353 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
341 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
334 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
347 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  25.69 
 
 
332 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
1250 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
363 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
280 aa  92  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2832  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
287 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0389241  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
270 aa  85.5  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.09 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  29.29 
 
 
300 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
273 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.57 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
633 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
331 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  27.59 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
384 aa  75.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.94 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.42 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
544 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  29.13 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 
1035 aa  72.4  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
230 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.39 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  31.66 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
581 aa  69.3  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
335 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.69 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
330 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
663 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>