More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1932 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  100 
 
 
392 aa  786  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  1.67668e-09  decreased coverage  7.52271e-10 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  81.59 
 
 
393 aa  643  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  4.77736e-05  unclonable  3.25116e-06 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  56.19 
 
 
395 aa  420  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  2.27935e-05  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  48.46 
 
 
442 aa  336  4e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  1.52852e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  48.46 
 
 
442 aa  336  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  7.46814e-05  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  47.51 
 
 
365 aa  322  1e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  45.98 
 
 
382 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.62475e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  46.76 
 
 
442 aa  315  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  45.66 
 
 
383 aa  313  5e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  46.37 
 
 
444 aa  310  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  6.79634e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  44.35 
 
 
383 aa  306  4e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.68219e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  45.21 
 
 
385 aa  306  5e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  45.8 
 
 
383 aa  305  8e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  8.61889e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  45.8 
 
 
382 aa  305  9e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00498e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  47.73 
 
 
373 aa  305  1e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  45.74 
 
 
404 aa  305  1e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.58995e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  46.51 
 
 
381 aa  304  2e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  44.32 
 
 
346 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  46.72 
 
 
377 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  43.89 
 
 
384 aa  299  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  46.06 
 
 
406 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  44.44 
 
 
381 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.41994e-08  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  45.94 
 
 
372 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  44.86 
 
 
493 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.24558e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  44.16 
 
 
449 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  44.38 
 
 
362 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.54988e-12  unclonable  1.37146e-08 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  43.18 
 
 
368 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  42.9 
 
 
368 aa  292  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  43.18 
 
 
368 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  5.35514e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  43.18 
 
 
368 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.69611e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  43.18 
 
 
368 aa  292  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.74855e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  43.18 
 
 
368 aa  292  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  5.44237e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  43.18 
 
 
368 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  43.18 
 
 
368 aa  292  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.10606e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  43.18 
 
 
368 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.88549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  43.18 
 
 
368 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.81059e-06  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  45.51 
 
 
360 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  8.76177e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  42.61 
 
 
366 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.56927e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  44.44 
 
 
359 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.94155e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  44.8 
 
 
536 aa  290  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  49.03 
 
 
536 aa  289  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  45.8 
 
 
407 aa  289  8e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  40.57 
 
 
475 aa  288  9e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  45.17 
 
 
344 aa  288  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  6.99393e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  44.89 
 
 
344 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.23432e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  41.5 
 
 
378 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  48.51 
 
 
544 aa  287  3e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  41.31 
 
 
443 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  41.13 
 
 
428 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  41.6 
 
 
440 aa  285  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  43.64 
 
 
538 aa  285  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  41.31 
 
 
441 aa  285  1e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  44.41 
 
 
391 aa  283  3e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  44.41 
 
 
391 aa  283  3e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  44.28 
 
 
537 aa  283  5e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  44.28 
 
 
537 aa  283  5e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  44.12 
 
 
506 aa  282  7e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  43.82 
 
 
535 aa  282  7e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  47.73 
 
 
560 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 
401 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  43.35 
 
 
532 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  41.36 
 
 
449 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  43.06 
 
 
534 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  43.33 
 
 
366 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  42.29 
 
 
491 aa  279  5e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  41.88 
 
 
429 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  47.73 
 
 
545 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  43.06 
 
 
366 aa  279  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  47.08 
 
 
545 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  47.08 
 
 
545 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  45.3 
 
 
552 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  43.48 
 
 
572 aa  276  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  42.78 
 
 
382 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  46.05 
 
 
533 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  40.61 
 
 
423 aa  276  6e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.0954e-06  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  42.7 
 
 
487 aa  276  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  2.72174e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  43.7 
 
 
369 aa  275  9e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  9.36712e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  45.72 
 
 
535 aa  275  1e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  44.07 
 
 
516 aa  275  1e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  41.46 
 
 
506 aa  275  1e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  46.13 
 
 
537 aa  274  2e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  42.9 
 
 
354 aa  274  2e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.26051e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  42.42 
 
 
491 aa  274  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  45.72 
 
 
537 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  42.45 
 
 
380 aa  272  8e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  43.54 
 
 
539 aa  272  8e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  43.9 
 
 
385 aa  272  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  42.9 
 
 
531 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  40.36 
 
 
557 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  42.98 
 
 
537 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  40.36 
 
 
557 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  45.07 
 
 
538 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  40.74 
 
 
503 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  40.36 
 
 
557 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  40.62 
 
 
556 aa  270  3e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  40.06 
 
 
382 aa  270  3e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  42.02 
 
 
499 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  40.88 
 
 
503 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  40.88 
 
 
503 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  45.48 
 
 
541 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>