271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1931 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1931  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  320  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000150217  decreased coverage  0.000000000468182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1476  protein of unknown function DUF150  61.81 
 
 
143 aa  169  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000465706  unclonable  0.0000025252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1233  hypothetical protein  44.97 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000841958  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  36.09 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  37.68 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  37.4 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  36.03 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  39.39 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  36.59 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  34.56 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  34.06 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  34.06 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  34.06 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  34.56 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  35.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  35.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  34.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  35.56 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  35.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  35.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  35.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  34.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  35.56 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  34.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  35.56 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  40.43 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  37.69 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1413  hypothetical protein  35.9 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000509228  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  36.29 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  36.7 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  39.29 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  31.97 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  42.2 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  37.89 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  33.86 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  35.17 
 
 
259 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  36.29 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  40.37 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  40.37 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  35.43 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  28.06 
 
 
152 aa  61.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  29.1 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  33.83 
 
 
183 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0832  protein of unknown function DUF150  33.06 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000130104  hitchhiker  0.000000375903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  37.27 
 
 
286 aa  60.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  33.94 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  35.43 
 
 
191 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  33.1 
 
 
262 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  33.02 
 
 
207 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0596  hypothetical protein  36.94 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2360  hypothetical protein  32.54 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  33.61 
 
 
196 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  33.08 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  33.82 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  33.82 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  35.04 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  38.83 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  33.88 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  33.82 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  33.88 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  30.47 
 
 
203 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  33.58 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  27.34 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  32.64 
 
 
259 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  33.1 
 
 
174 aa  58.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  40.37 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  37.97 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  40.37 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  35.92 
 
 
151 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  40.37 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  34.07 
 
 
162 aa  57.4  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  33.96 
 
 
165 aa  57.4  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  30.14 
 
 
151 aa  57.4  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  33.82 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  34.62 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  31.31 
 
 
201 aa  57.4  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  34.86 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  36.89 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  29.37 
 
 
204 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  39.81 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  39.45 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  34.86 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  34.15 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  31.71 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  34.86 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  34.86 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  37.74 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  37.86 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  38.04 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  29.92 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  32.31 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  35 
 
 
206 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  35.64 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  34.95 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  34.95 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  34.95 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0529  hypothetical protein  38.71 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>