More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1919 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 360 aa  695    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  0.000000909205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  64.8 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  39.34 
 
 		 377 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  40.38 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  37.77 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 380 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  39.09 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  40.46 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  35.47 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  40.46 
 
 		 373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.92 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.1 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.1 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  39 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  39.22 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  38.37 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  37.71 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  34.76 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  41.03 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  38.71 
 
 		 366 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  40.46 
 
 		 373 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  38.38 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  37.47 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  38.23 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  35.13 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.22 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 		 419 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  36.83 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  37.12 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  37.54 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1203  rod shape-determining protein RodA  39.31 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  38.29 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  37.23 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  35.75 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  37.39 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  38.25 
 
 		 390 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  34.7 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  38.25 
 
 		 390 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  37.93 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  34.18 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  36.02 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.52 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  34.12 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  34.55 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  36.54 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  39.23 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0055  rod shape-determining protein RodA  37.09 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00692025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.11 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.91 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.91 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  32.5 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  37.06 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  37.06 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0080  rod shape-determining protein RodA  37.63 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0240  rod shape-determining protein RodA  40.75 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  37.06 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  36.87 
 
 		 367 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0941  rod shape-determining protein RodA  39.41 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.98 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  37.06 
 
 		 368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.61 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  37.86 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  42.81 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  36.12 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  38.25 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 373 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  38.05 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  36.47 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  37.98 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.58 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  34.51 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.5 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  36.19 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  37.6 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  36.87 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  40.74 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.52 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3169  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0322  rod shape-determining protein RodA  37.26 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  37.7 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1106  cell cycle protein  33.24 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.860681  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  36.49 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.64 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  37.26 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  38.5 
 
 		 366 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.47 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  36.12 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  36.66 
 
 		 376 aa  179  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  36.96 
 
 		 402 aa  179  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0063  rod shape-determining (RODA protein) transmembrane  36.91 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913941  normal  0.999134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>