More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1908 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1908  acetolactate synthase small subunit  100 
 
 
169 aa  333  5e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00435991  hitchhiker  0.0000119915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2144  acetolactate synthase, small subunit  83.83 
 
 
170 aa  288  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0207979  normal  0.0119261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  53.61 
 
 
166 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.69 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.38 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0601  acetolactate synthase, small subunit  56.41 
 
 
202 aa  177  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.622073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  54.27 
 
 
172 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  54.27 
 
 
172 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.33 
 
 
167 aa  173  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.5 
 
 
172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  46.95 
 
 
164 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  48.17 
 
 
163 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  52.44 
 
 
163 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  55.56 
 
 
164 aa  168  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.37 
 
 
161 aa  167  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  51.23 
 
 
170 aa  167  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  50.62 
 
 
159 aa  167  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
169 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
169 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
169 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  51.88 
 
 
167 aa  166  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.22 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  51.2 
 
 
165 aa  165  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  53.16 
 
 
161 aa  164  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.37 
 
 
161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.56 
 
 
164 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.61 
 
 
163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.39 
 
 
163 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.39 
 
 
163 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.23 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1556  acetolactate synthase, small subunit  53.5 
 
 
180 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  50.63 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  51.22 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  49.36 
 
 
187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  48.45 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1967  acetolactate synthase, small subunit  52.87 
 
 
180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.78 
 
 
163 aa  160  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.39 
 
 
163 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.39 
 
 
163 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  45.73 
 
 
164 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.78 
 
 
163 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.17 
 
 
163 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.78 
 
 
163 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.78 
 
 
163 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.61 
 
 
163 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.78 
 
 
163 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.78 
 
 
163 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.78 
 
 
163 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 
164 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1241  acetolactate synthase, small subunit  52.87 
 
 
179 aa  157  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3323  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.39 
 
 
163 aa  157  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  48.77 
 
 
170 aa  157  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  50.63 
 
 
168 aa  157  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.17 
 
 
163 aa  157  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 
161 aa  157  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1746  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  157  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.34 
 
 
164 aa  157  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  49.39 
 
 
163 aa  157  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.78 
 
 
163 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.78 
 
 
163 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0683  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.2 
 
 
169 aa  157  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.92 
 
 
163 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.53 
 
 
163 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  46.3 
 
 
161 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  46.3 
 
 
163 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  52.23 
 
 
172 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.45 
 
 
167 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.45 
 
 
167 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.59 
 
 
182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 
172 aa  154  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  49.04 
 
 
160 aa  154  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.23 
 
 
172 aa  152  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1192  acetolactate synthase, small subunit  45.91 
 
 
202 aa  153  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.43 
 
 
172 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42510  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.73 
 
 
163 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.34 
 
 
163 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0982  acetolactate synthase, small subunit  45.73 
 
 
163 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.73 
 
 
163 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0605  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.91 
 
 
158 aa  152  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.911108  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.34 
 
 
163 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  49.69 
 
 
169 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62150  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.34 
 
 
163 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0299879 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.2 
 
 
176 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>