More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1876 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  93.85 
 
 		 179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  86.36 
 
 		 178 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  69.13 
 
 		 184 aa  235  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  70.95 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.59 
 
 		 226 aa  231  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  69.59 
 
 		 271 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  67.11 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.41 
 
 		 184 aa  227  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  71.33 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  69.59 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  66.22 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.74 
 
 		 183 aa  225  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  64.38 
 
 		 226 aa  225  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  66.44 
 
 		 184 aa  225  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  68.31 
 
 		 184 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  64.1 
 
 		 184 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  64.1 
 
 		 184 aa  224  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  66.44 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  63.76 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  63.12 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  65.1 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  67.61 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  71.13 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  67.61 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.36 
 
 		 183 aa  222  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.86 
 
 		 180 aa  221  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  66.9 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.79 
 
 		 184 aa  219  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  65.1 
 
 		 183 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.56 
 
 		 169 aa  219  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  68.53 
 
 		 174 aa  220  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  61.11 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.43 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.77 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.61 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  64.19 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  61.39 
 
 		 167 aa  214  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  59.87 
 
 		 173 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  59.63 
 
 		 165 aa  213  9e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 		 184 aa  211  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  62.34 
 
 		 170 aa  211  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  62.42 
 
 		 250 aa  211  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  59.88 
 
 		 170 aa  210  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  57.99 
 
 		 268 aa  209  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 268 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  58.9 
 
 		 172 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  59.38 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 172 aa  208  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 172 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 172 aa  208  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.49 
 
 		 229 aa  208  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 172 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 172 aa  208  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  58.28 
 
 		 172 aa  207  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  63.12 
 
 		 170 aa  207  8e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  61.59 
 
 		 169 aa  206  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  61.84 
 
 		 158 aa  205  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  61.84 
 
 		 158 aa  205  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.88 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.84 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  59.01 
 
 		 170 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 		 159 aa  204  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1749  NADH dehydrogenase subunit B  59.87 
 
 		 167 aa  204  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1563  NADH dehydrogenase subunit B  59.87 
 
 		 167 aa  204  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.731652  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.14 
 
 		 170 aa  204  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.57 
 
 		 169 aa  204  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1929  NADH dehydrogenase subunit B  59.87 
 
 		 167 aa  204  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.659926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  65.75 
 
 		 191 aa  204  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  57.58 
 
 		 167 aa  203  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0182  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 169 aa  203  9e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.14 
 
 		 794 aa  203  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 		 159 aa  203  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 		 159 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.01 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  60.54 
 
 		 264 aa  201  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  57.82 
 
 		 791 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  53.16 
 
 		 168 aa  202  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.43 
 
 		 170 aa  201  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.63 
 
 		 792 aa  201  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2861  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.84 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0909969  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1617  NADH dehydrogenase subunit B  60.4 
 
 		 161 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0546  NADH dehydrogenase subunit B  60.4 
 
 		 161 aa  201  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 		 220 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 		 160 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 		 220 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 		 220 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 		 220 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 		 220 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.14 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.06 
 
 		 167 aa  199  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  55.97 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  55.97 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.68 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>