More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1872 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  100 
 
 
438 aa  907    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.2 
 
 
446 aa  650    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  86.93 
 
 
444 aa  806    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.27 
 
 
421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.5 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  52.96 
 
 
425 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  52.96 
 
 
425 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  55.28 
 
 
426 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.27 
 
 
429 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.71 
 
 
427 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.56 
 
 
439 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.96 
 
 
443 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.46 
 
 
447 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.71 
 
 
427 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  51.57 
 
 
424 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  53.2 
 
 
449 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  54.05 
 
 
428 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.8 
 
 
706 aa  428  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.25 
 
 
448 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  51.1 
 
 
428 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.58 
 
 
425 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.17 
 
 
433 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1305  NADH dehydrogenase I subunit F  51.6 
 
 
430 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.85 
 
 
441 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.15 
 
 
434 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.41 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.74 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  52.84 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  53.44 
 
 
445 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.71 
 
 
425 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  51.67 
 
 
428 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.23 
 
 
442 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.74 
 
 
438 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.63 
 
 
454 aa  413  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1612  NADH dehydrogenase (quinone)  47.25 
 
 
466 aa  412  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.709157  normal  0.640028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.33 
 
 
452 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1882  NADH dehydrogenase I subunit F  49.4 
 
 
441 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.06 
 
 
453 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.59 
 
 
442 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.25 
 
 
431 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.12 
 
 
456 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.8 
 
 
424 aa  408  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.52 
 
 
452 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.88 
 
 
422 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.83 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 
467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.57 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2215  NADH dehydrogenase I subunit F  48.92 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.58 
 
 
451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43944  predicted protein  47.96 
 
 
493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.54 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.76 
 
 
443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.07 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.82 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  49.13 
 
 
434 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  49.27 
 
 
429 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
431 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  49.38 
 
 
434 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.49 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0894  NADH dehydrogenase I subunit F  49.13 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13206  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0926  NADH dehydrogenase I subunit F  48.77 
 
 
431 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.49 
 
 
434 aa  398  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  49.75 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4556  NADH dehydrogenase I subunit F  49.39 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0802  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  48.64 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.71 
 
 
444 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.62 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.37 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.62 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  48.1 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  48.19 
 
 
422 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0807  NADH dehydrogenase I subunit F  49.88 
 
 
435 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.662201  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  47.21 
 
 
433 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  48.52 
 
 
441 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.99 
 
 
427 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.92 
 
 
441 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.92 
 
 
441 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0783  NADH dehydrogenase I subunit F  48.64 
 
 
435 aa  398  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.860034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.42 
 
 
439 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  47.95 
 
 
422 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.92 
 
 
441 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  48.26 
 
 
448 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.61 
 
 
443 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1408  NADH dehydrogenase (quinone)  50.98 
 
 
448 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344302  normal  0.160337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.84 
 
 
438 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>