127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1818 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  813    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  66.98 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  40.43 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  37.35 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  33.97 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  37.75 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  33.1 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  30.33 
 
 		 828 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  29.1 
 
 		 488 aa  152  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  30.11 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1662  hypothetical protein  30.84 
 
 		 493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  32.3 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  27.01 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  28.84 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  29.82 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  26.33 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  32.5 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  30.47 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  29.93 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  29.93 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  30.67 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  27.19 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  31.04 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  27.03 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  30.86 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  29.29 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  30.86 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  27.85 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  30.79 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  29.6 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  26.77 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  27.23 
 
 		 456 aa  99.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  33.07 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  28.54 
 
 		 433 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  33.07 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  30.48 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  27.27 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  25.17 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  28.68 
 
 		 496 aa  96.3  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  31.58 
 
 		 447 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  32 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  28.53 
 
 		 488 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  28.25 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  32.28 
 
 		 470 aa  94  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  29.01 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  31.02 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  26.84 
 
 		 436 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  25.99 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  24.83 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  32.59 
 
 		 462 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  32.92 
 
 		 464 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  26.54 
 
 		 438 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  30.8 
 
 		 425 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  28.91 
 
 		 453 aa  90.1  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  30.86 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  31.3 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  30.49 
 
 		 434 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  26.83 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  28.18 
 
 		 443 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  29.68 
 
 		 516 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  28.29 
 
 		 470 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  29.02 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1624  protein of unknown function DUF107  28.8 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  30.79 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  30.89 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  26.79 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  30.77 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  30.77 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  30.49 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  29.97 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  30.25 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  27.62 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  29.92 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  30.43 
 
 		 557 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  27.65 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  31.67 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  41.89 
 
 		 158 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  30.51 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1632  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1666  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  30 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  31.21 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  26.05 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  28.37 
 
 		 525 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0857  hypothetical protein  37.11 
 
 		 163 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  27.94 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  28.29 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  26.44 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  26.8 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  26.45 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  25.41 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  25.08 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  26.87 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  27.18 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  27.69 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  27.43 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  26.11 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  26.12 
 
 		 501 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  26.65 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  29.65 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>