13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1772 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  251  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0834  hypothetical protein  55.36 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0051  hypothetical protein  28.44 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  36.84 
 
 
129 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  36.07 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  36.07 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  36.07 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3780  hypothetical protein  32 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00228572  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0404  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  28.33 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  32.03 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  34.91 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  33.63 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>