249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1757 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 218 aa  423  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  68.12 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  50.76 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  43.35 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  42.93 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  39.44 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  41.87 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  44.15 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  45.25 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  44.86 
 
 		 366 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  44.69 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  40.5 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  41.06 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  41.06 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  39.61 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  39.61 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  39.61 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  39.61 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  39.61 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  39.61 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  39.61 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  39.13 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  43.82 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  45.02 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  41.63 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  38.92 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  40 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 220 aa  131  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  35.94 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  42.77 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  36.1 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  37.07 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  41.24 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  41.67 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  41.67 
 
 		 249 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  39.38 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  40.38 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  40.38 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  39.51 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  40.38 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  40.38 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  40.38 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  40.38 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  43.98 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  39.8 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  40.54 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  38.53 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  39.13 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  48.1 
 
 		 246 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  40.87 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  38.43 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  40.87 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  40.87 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  40.21 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  40.87 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  40.87 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  40.98 
 
 		 224 aa  121  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  38.1 
 
 		 274 aa  121  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  37.85 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  43.14 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  40.86 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  39.81 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  36.22 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  39.39 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  40.82 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  41.33 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  40.38 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  39.59 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  38.89 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  38.94 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0531  hemolysin III  45.75 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.666008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  38.58 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  38.94 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  41.15 
 
 		 205 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  40.87 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  40.87 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  38.46 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  38.92 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  40.87 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  42.68 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  33.98 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  39.02 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  40.51 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  36.54 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  34.76 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  40.72 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  40.87 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  34.69 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  35.94 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  38.05 
 
 		 243 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  39.9 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  39.9 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  42.86 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  42.07 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1862  hemolysin III family channel protein  38.31 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  38.57 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>