More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1746 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1746  aminotransferase class V  100 
 
 		 407 aa  822    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.676598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  43.88 
 
 		 389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  41.33 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  41.58 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  38.29 
 
 		 399 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  36.67 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1607  aminotransferase class V  36.5 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  35 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1215  selenocysteine lyase  34.72 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00299865  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  34.97 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  34.97 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  34.97 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  34.72 
 
 		 464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  35.7 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  34.72 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5559  aminotransferase class V  33.77 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237097  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0174  aminotransferase class V  34.85 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0764904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  28.79 
 
 		 684 aa  169  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3487  selenocysteine lyase / isopenicillin N epimerase  31.56 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0293361  normal  0.0990887 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  24.75 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61494  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  26.49 
 
 		 430 aa  159  8e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0727802 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06227  aminotransferase family protein (LolT), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13295)  33.15 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46105  predicted protein  31.14 
 
 		 485 aa  149  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  25.06 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  31.3 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  27.11 
 
 		 422 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  32.09 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  30.65 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  28.32 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  31.06 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  25.82 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  30.42 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  32.22 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  30.36 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  26.46 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  32.5 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  35.56 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  31.36 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.99 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  28.4 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.73 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.25 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.85 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  24.48 
 
 		 488 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.46 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  27.11 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.3 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.26 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.97 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.54 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.8 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  29.34 
 
 		 495 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  26.85 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  26.79 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  27.12 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  26.49 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  26.49 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  26.58 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3786  aminotransferase, class V  24.11 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  28.35 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  25.13 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  27.21 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.64 
 
 		 407 aa  94  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.18 
 
 		 429 aa  93.6  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  24.34 
 
 		 416 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.53 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  26.51 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.84 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  23.02 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  24.22 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  29.06 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2273  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.03 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  24.6 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  24.01 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.55 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.55 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  38.26 
 
 		 287 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.14 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2611  aminotransferase, class V  26.97 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  23.62 
 
 		 394 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.21 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.02 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.12 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.12 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.96 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  24.92 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  32.22 
 
 		 395 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4214  aminotransferase, class V  24.62 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1642  aminotransferase, class V  25.08 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.01 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  25.32 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  30.34 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.77 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  26.63 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  27.14 
 
 		 604 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  27.14 
 
 		 604 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  28.24 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  26.69 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.11 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>