More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1664 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
240 aa  465  1e-130  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  73.53 
 
 
241 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  55.17 
 
 
255 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  54.22 
 
 
286 aa  234  1e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
247 aa  233  2e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  53.62 
 
 
285 aa  233  2e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  50.85 
 
 
277 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  49.57 
 
 
248 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
248 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  50.43 
 
 
256 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  51.69 
 
 
254 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
248 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
267 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  49.34 
 
 
250 aa  225  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  49.36 
 
 
244 aa  224  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  51.08 
 
 
257 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  51.08 
 
 
257 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 
258 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63261e-06 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 
258 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 
248 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 
248 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 
248 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  48.95 
 
 
254 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
249 aa  221  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
248 aa  221  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
248 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  47.86 
 
 
248 aa  220  1e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  48.52 
 
 
254 aa  219  2e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
248 aa  220  2e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
248 aa  220  2e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  48.51 
 
 
240 aa  220  2e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
248 aa  220  2e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
248 aa  220  2e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
248 aa  220  2e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
248 aa  220  2e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
244 aa  218  8e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  47.64 
 
 
244 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
244 aa  216  3e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 
251 aa  215  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  9.81065e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
244 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
244 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
244 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
244 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  49.57 
 
 
244 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
244 aa  214  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 
244 aa  214  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  51.54 
 
 
246 aa  214  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  49.78 
 
 
265 aa  214  1e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  49.78 
 
 
264 aa  214  1e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  49.78 
 
 
265 aa  214  1e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
244 aa  214  1e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
244 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
244 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
244 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
244 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
244 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
244 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 
249 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  46.61 
 
 
241 aa  197  1e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  46.61 
 
 
241 aa  197  1e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 
251 aa  197  1e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  46.61 
 
 
255 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  48.26 
 
 
257 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  47.39 
 
 
257 aa  188  6e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 
243 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  48.75 
 
 
257 aa  183  2e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  41.42 
 
 
247 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
233 aa  169  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.19 
 
 
243 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
243 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
243 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
243 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
243 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
243 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
248 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
248 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
255 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  41.45 
 
 
246 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  46.36 
 
 
268 aa  153  3e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
266 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
248 aa  151  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  39.48 
 
 
245 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  41.63 
 
 
244 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
225 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
232 aa  147  1e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
247 aa  147  2e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
235 aa  144  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  40.37 
 
 
239 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
248 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
244 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
247 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  32.02 
 
 
232 aa  142  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
249 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 
242 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
232 aa  142  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  44.6 
 
 
244 aa  141  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  40.59 
 
 
246 aa  140  1e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  39.55 
 
 
238 aa  140  2e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  32.75 
 
 
233 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
236 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>