More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1645 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  317  5e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  50.34 
 
 
157 aa  147  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 
151 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 
162 aa  124  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
153 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
153 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  42.75 
 
 
151 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 
151 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  46.27 
 
 
159 aa  121  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  43.07 
 
 
151 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
149 aa  121  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
170 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
170 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 
153 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  42.34 
 
 
164 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  42.34 
 
 
164 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  39.55 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  42.75 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 
160 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  42.03 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
153 aa  110  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 
150 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 
150 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
164 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 
157 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
153 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 
173 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
159 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
165 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 
152 aa  103  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
148 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 
149 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
151 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.93 
 
 
187 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
163 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
163 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
153 aa  100  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
162 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  36.88 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 
145 aa  97.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
162 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  36.5 
 
 
145 aa  97.1  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  36.17 
 
 
162 aa  97.1  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.19 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  34.93 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 
157 aa  94.4  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 
160 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  37.21 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
165 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.23 
 
 
152 aa  91.3  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
174 aa  90.5  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  36.8 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 
167 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  37.3 
 
 
166 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.75 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 
136 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
145 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
153 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>