More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1625 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 
293 aa  600  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  38.81 
 
 
292 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  36.95 
 
 
297 aa  198  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  37.92 
 
 
315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  43.51 
 
 
313 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  40.57 
 
 
334 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  41.1 
 
 
615 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 
633 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  124  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  32.59 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  31.34 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
303 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
323 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  31.03 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  22.7 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  24.82 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  24.4 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.86 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  33.98 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
1299 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1185  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
333 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.16 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  25.47 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  25.93 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 
327 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  23.45 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  42.27 
 
 
304 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  25.93 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  25.93 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 
335 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.71 
 
 
754 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  20.19 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
314 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
489 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  31.67 
 
 
320 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
544 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
345 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
327 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
443 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1377  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.9 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
311 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0770  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  32.84 
 
 
997 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
401 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
455 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  29.03 
 
 
1074 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  30.91 
 
 
442 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
366 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  22.53 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4321  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.86 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
372 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1232  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
481 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>