More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1556 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
536 aa  1064  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  32.37 
 
 
360 aa  81.3  4e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  37.86 
 
 
624 aa  80.9  6e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  28.86 
 
 
631 aa  80.5  8e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  30.64 
 
 
760 aa  79.7  1e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  31.98 
 
 
360 aa  79.3  2e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.22253e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  30.64 
 
 
760 aa  79  2e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  31.98 
 
 
360 aa  79.3  2e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  31.98 
 
 
360 aa  79.3  2e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  31.98 
 
 
360 aa  79.3  2e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  5.41964e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  31.21 
 
 
766 aa  78.2  3e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  31.21 
 
 
766 aa  76.6  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  31.21 
 
 
755 aa  76.6  1e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  34.71 
 
 
669 aa  75.5  2e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.64 
 
 
542 aa  75.1  3e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  23.98 
 
 
288 aa  74.7  4e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  30.64 
 
 
765 aa  74.3  5e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  31.21 
 
 
772 aa  73.9  7e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  30.84 
 
 
413 aa  73.2  1e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  30.64 
 
 
779 aa  72.8  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  30.23 
 
 
360 aa  72  2e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  30.23 
 
 
526 aa  72.4  2e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  28.48 
 
 
447 aa  71.6  3e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  30.06 
 
 
1756 aa  72  3e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  33.33 
 
 
693 aa  71.2  4e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  28.98 
 
 
333 aa  71.2  5e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  30.68 
 
 
935 aa  70.9  5e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.3 
 
 
477 aa  70.5  7e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.18218e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.65 
 
 
1821 aa  70.1  9e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  33.64 
 
 
546 aa  69.7  1e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  33.05 
 
 
414 aa  68.9  2e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.82 
 
 
558 aa  68.9  2e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  28.32 
 
 
693 aa  68.2  3e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  30.59 
 
 
921 aa  68.2  4e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.37339e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  28.68 
 
 
1710 aa  67.4  6e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  28.91 
 
 
396 aa  67  8e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  26.38 
 
 
688 aa  66.6  1e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  32.86 
 
 
518 aa  66.2  2e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1282  putative S-layer protein  30.29 
 
 
223 aa  66.2  2e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.84 
 
 
1029 aa  65.1  3e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  38.57 
 
 
784 aa  64.7  4e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  36.11 
 
 
932 aa  64.7  4e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  30 
 
 
629 aa  63.9  7e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 
640 aa  63.9  8e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  32.71 
 
 
552 aa  63.2  1e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  30.86 
 
 
379 aa  63.2  1e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.49153e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  30.81 
 
 
383 aa  63.5  1e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0715  S-layer domain-containing protein  34.25 
 
 
879 aa  63.5  1e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  30.81 
 
 
383 aa  63.5  1e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  23.6 
 
 
542 aa  63.5  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  30.81 
 
 
383 aa  63.5  1e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  27.05 
 
 
754 aa  63.2  1e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  24.73 
 
 
1081 aa  62.8  2e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  29.73 
 
 
506 aa  62.8  2e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  26.4 
 
 
2313 aa  62.8  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2384  S-layer-like domain-containing protein  29.93 
 
 
189 aa  62  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  27.22 
 
 
223 aa  61.6  3e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  25.9 
 
 
575 aa  61.2  4e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  40.45 
 
 
343 aa  61.2  4e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  3.42894e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  26.29 
 
 
218 aa  61.6  4e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  25.42 
 
 
1194 aa  60.8  6e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  22.86 
 
 
1226 aa  60.8  6e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.81 
 
 
1328 aa  60.8  6e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1225  S-layer protein, putative  29.71 
 
 
223 aa  60.8  6e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  30.29 
 
 
926 aa  60.5  7e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  32.14 
 
 
604 aa  60.5  8e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  47.73 
 
 
1036 aa  60.5  8e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  41.54 
 
 
361 aa  60.5  8e-08  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  30.67 
 
 
758 aa  60.1  9e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1127  S-layer protein  29.48 
 
 
223 aa  59.7  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.600339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  32.73 
 
 
472 aa  60.1  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1177  putative S-layer protein  30.27 
 
 
344 aa  60.1  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1093  S-layer protein  30.27 
 
 
344 aa  60.1  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1026  S-layer protein  29.24 
 
 
223 aa  59.7  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00354744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1205  putative S-layer protein  29.48 
 
 
223 aa  59.7  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  26 
 
 
461 aa  60.1  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.74812e-07 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  26 
 
 
461 aa  60.1  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  39.71 
 
 
468 aa  60.1  1e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  4.98121e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.99 
 
 
410 aa  59.7  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.38501e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  35.44 
 
 
932 aa  59.7  1e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  1.40027e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1962  putative S-layer protein  24.71 
 
 
331 aa  60.1  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1962e-14 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1021  S-layer protein  30.27 
 
 
346 aa  60.1  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1048  S-layer protein  29.48 
 
 
223 aa  59.7  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  9.83689e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  27.91 
 
 
1009 aa  59.3  1e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  26 
 
 
461 aa  60.1  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  24.73 
 
 
710 aa  58.9  2e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.86639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  44.62 
 
 
408 aa  59.3  2e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.99 
 
 
410 aa  59.3  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  8.72091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  50.94 
 
 
424 aa  58.9  2e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  26.7 
 
 
685 aa  59.3  2e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.99 
 
 
410 aa  59.3  2e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.21919e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.99 
 
 
410 aa  59.3  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.64272e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  28.99 
 
 
410 aa  58.9  2e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.0106e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  28.02 
 
 
219 aa  58.9  2e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  41.54 
 
 
330 aa  58.9  2e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  28.16 
 
 
376 aa  58.9  2e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  28.99 
 
 
410 aa  58.9  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  28.02 
 
 
219 aa  58.9  2e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1252  putative S-layer protein  29.73 
 
 
341 aa  58.5  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  26 
 
 
461 aa  58.9  3e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.47347e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>