More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1554 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  100 
 
 
339 aa  677    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2052  integrase family protein  67.9 
 
 
353 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00829339  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1117  phage integrase  39 
 
 
369 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.343038  decreased coverage  0.00190839 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2776  phage integrase  33.64 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0149476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  31.61 
 
 
291 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  33.88 
 
 
299 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.84 
 
 
330 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.57 
 
 
299 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.36 
 
 
303 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.68 
 
 
303 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.26 
 
 
299 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.48 
 
 
299 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.92 
 
 
315 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  31.45 
 
 
300 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 
299 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  34.98 
 
 
304 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.4 
 
 
330 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.22 
 
 
299 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  27.19 
 
 
299 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.15 
 
 
299 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  30.51 
 
 
299 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  30.55 
 
 
304 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 
296 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 
321 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  29.39 
 
 
318 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.87 
 
 
299 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  30.74 
 
 
317 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.85 
 
 
304 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  32.24 
 
 
310 aa  99.4  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.81 
 
 
302 aa  99.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.46 
 
 
291 aa  99  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  30.1 
 
 
335 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.84 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  22.68 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 
301 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  30.33 
 
 
297 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  35.96 
 
 
353 aa  96.7  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  28.22 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 
300 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  25.9 
 
 
296 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  27.81 
 
 
335 aa  96.3  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.9 
 
 
300 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.73 
 
 
311 aa  95.9  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.9 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  29.48 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  31.62 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.77 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  28.53 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.93 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.93 
 
 
300 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  28.44 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.55 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.45 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
298 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.78 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  31.6 
 
 
307 aa  94  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  31.27 
 
 
307 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  28.52 
 
 
298 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3046  integrase family protein  31.49 
 
 
310 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.08 
 
 
298 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.52 
 
 
298 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.51 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.08 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  24.6 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  28.43 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  35.39 
 
 
354 aa  92.8  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  35.39 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  35.39 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  32.16 
 
 
268 aa  92.4  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.08 
 
 
284 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  30.69 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  32.13 
 
 
304 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.22 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  26.43 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  31.12 
 
 
298 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  34.83 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  30.72 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  26.43 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  32.21 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  26.07 
 
 
304 aa  90.5  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  31.62 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  30.65 
 
 
304 aa  90.1  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.93 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  30.77 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  29.28 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0131  integrase family protein  31.79 
 
 
312 aa  89.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.144823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  30.77 
 
 
283 aa  89.4  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  34.27 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.66 
 
 
299 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  27.57 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.95 
 
 
330 aa  89.4  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.4 
 
 
303 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>