141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1552 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  83.15 
 
 		 280 aa  482  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  68.4 
 
 		 275 aa  384  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  69.49 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  66.67 
 
 		 282 aa  371  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  69.06 
 
 		 279 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  63.91 
 
 		 280 aa  358  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  62.27 
 
 		 297 aa  345  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  63.32 
 
 		 276 aa  344  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  63.7 
 
 		 276 aa  342  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  62.17 
 
 		 278 aa  341  7e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  61.34 
 
 		 278 aa  341  9e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  58.82 
 
 		 284 aa  338  7e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  62.36 
 
 		 277 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  58.46 
 
 		 284 aa  335  5e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  60.61 
 
 		 277 aa  325  7e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  57.63 
 
 		 268 aa  324  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  61.09 
 
 		 276 aa  317  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  64.94 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  56.98 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  57.31 
 
 		 272 aa  315  6e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  57.61 
 
 		 281 aa  315  6e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  55.47 
 
 		 274 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  54.34 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  58.02 
 
 		 283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  54.37 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  59.06 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  59.92 
 
 		 292 aa  297  2e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  58.58 
 
 		 283 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  57.69 
 
 		 279 aa  294  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  58.02 
 
 		 265 aa  292  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  55.43 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  42.86 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2112  hypothetical protein  32.27 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  36.89 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  30.68 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  26.98 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  35.63 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4476  hypothetical protein  53.85 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  30.67 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  25.33 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  34.11 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  31.78 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  27.68 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  26.55 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  26.16 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  31.45 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1326  hypothetical protein  36.96 
 
 		 388 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  27.82 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  36.71 
 
 		 620 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  40.91 
 
 		 407 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  37.84 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  30.61 
 
 		 354 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.96 
 
 		 633 aa  49.7  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  30 
 
 		 828 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  32.97 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  35.14 
 
 		 368 aa  48.9  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  38.81 
 
 		 216 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  35.14 
 
 		 368 aa  48.9  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  37.29 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  37.68 
 
 		 447 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  25.6 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  29.35 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  35.96 
 
 		 633 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  35.82 
 
 		 458 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  46.43 
 
 		 452 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  27.05 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  37.18 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.58 
 
 		 621 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  32.99 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  29.01 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  38.98 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.73 
 
 		 620 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  36.36 
 
 		 356 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  34.52 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0841  hypothetical protein  32.08 
 
 		 394 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.83 
 
 		 613 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  38.98 
 
 		 684 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  38.98 
 
 		 683 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  38.98 
 
 		 684 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.24 
 
 		 661 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.71 
 
 		 613 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  37.29 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.68 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  34.31 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  37.29 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  32.2 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  25 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.7 
 
 		 640 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.87 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  45.76 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.58 
 
 		 613 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  35 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  35 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.29 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  35.59 
 
 		 689 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  33.68 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.33 
 
 		 584 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  33.73 
 
 		 612 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>