More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1536 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1536  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
146 aa  296  7e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  6.33501e-09  normal  0.222947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  65.49 
 
 
142 aa  194  4e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  55.78 
 
 
147 aa  165  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 
142 aa  162  1e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.31451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
145 aa  162  2e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.18025e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  54.55 
 
 
144 aa  161  2e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.57006e-06  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1734  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
147 aa  160  4e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0413621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  54.93 
 
 
146 aa  159  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  60.61 
 
 
146 aa  156  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  52.05 
 
 
149 aa  156  9e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  52.11 
 
 
147 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  54.55 
 
 
148 aa  156  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  9.65518e-09  hitchhiker  9.92925e-11 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  51.02 
 
 
149 aa  155  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  55 
 
 
145 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 
142 aa  154  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.33795e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  58.73 
 
 
143 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.78919e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 
143 aa  153  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.18039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 
144 aa  153  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  54.41 
 
 
151 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  54.41 
 
 
151 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 
143 aa  153  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.56517e-13  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 
142 aa  153  9e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 
142 aa  153  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  6.74786e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  54.96 
 
 
145 aa  153  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.51399e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 
149 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
151 aa  152  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  53.49 
 
 
142 aa  151  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 
151 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 
151 aa  151  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  51.45 
 
 
142 aa  151  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.18641e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  54.41 
 
 
149 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  50.75 
 
 
142 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 
142 aa  151  3e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  151  3e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  151  3e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 
142 aa  151  3e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.18525e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 
142 aa  151  3e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  6.79553e-07  normal  0.257999 
 
 
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  53.91 
 
 
142 aa  151  3e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.05698e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  51.37 
 
 
149 aa  151  3e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  50.37 
 
 
142 aa  151  3e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 
142 aa  151  3e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 
142 aa  151  3e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  54.41 
 
 
148 aa  151  3e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  51.45 
 
 
142 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.28707e-09  hitchhiker  9.18521e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  51.45 
 
 
142 aa  151  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.45483e-07  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  50.37 
 
 
142 aa  150  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  52.11 
 
 
149 aa  150  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  50.75 
 
 
142 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 
142 aa  150  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.21803e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  51.45 
 
 
142 aa  151  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  51.45 
 
 
142 aa  151  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.56575e-09  decreased coverage  1.94665e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  50.37 
 
 
142 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.05135e-07  hitchhiker  3.559e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.80495e-06  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  50.7 
 
 
147 aa  150  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.5141e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 
142 aa  150  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.58843e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  51.82 
 
 
143 aa  150  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  50.72 
 
 
143 aa  150  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.49881e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 
147 aa  150  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  149  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.11952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  51.85 
 
 
142 aa  149  9e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.52627e-09  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 
142 aa  149  9e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  2.71958e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 
142 aa  149  9e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 
145 aa  149  9e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.14694e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 
147 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  57.72 
 
 
143 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.58972e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 
149 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  149  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  7.97457e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  52.67 
 
 
145 aa  148  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  9.86136e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
151 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  50.35 
 
 
145 aa  148  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-05  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  50.35 
 
 
147 aa  148  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  51.02 
 
 
150 aa  148  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  50.37 
 
 
142 aa  148  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  54.96 
 
 
147 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 
147 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.23224e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  52.67 
 
 
145 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.80183e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  52.67 
 
 
145 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.03793e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  49.65 
 
 
147 aa  148  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  8.31745e-05  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  52.67 
 
 
145 aa  148  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.45264e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 
147 aa  148  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  51.15 
 
 
145 aa  148  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.68177e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  52.67 
 
 
145 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  52.67 
 
 
145 aa  148  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  51.82 
 
 
154 aa  147  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  52.67 
 
 
145 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.63354e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  50 
 
 
142 aa  147  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.54571e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  51.94 
 
 
170 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  52.67 
 
 
145 aa  148  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.75046e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  52.48 
 
 
145 aa  147  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  1.19852e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
143 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.97035e-08  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  50.69 
 
 
161 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  7.734e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
142 aa  147  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  51.75 
 
 
147 aa  147  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
142 aa  146  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.92865e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  47.89 
 
 
142 aa  147  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  49.63 
 
 
142 aa  146  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.22799e-07  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>