More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1532 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
460 aa  923    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.52 
 
 
459 aa  733    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.66 
 
 
462 aa  578  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.29 
 
 
462 aa  579  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.97 
 
 
469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.53 
 
 
467 aa  501  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.79 
 
 
468 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 
468 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.53 
 
 
467 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.74 
 
 
471 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.79 
 
 
468 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.85 
 
 
463 aa  495  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.01 
 
 
468 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.94 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.99 
 
 
467 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.2 
 
 
467 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.47 
 
 
581 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.4 
 
 
468 aa  482  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.13 
 
 
466 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.99 
 
 
467 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.18 
 
 
467 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.72 
 
 
470 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.53 
 
 
467 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.7 
 
 
467 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.62 
 
 
467 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.48 
 
 
466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.84 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.46 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.1 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.12 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.12 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.12 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.12 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.19 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.12 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.89 
 
 
466 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  53.85 
 
 
500 aa  467  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.12 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.68 
 
 
480 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.78 
 
 
463 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.92 
 
 
467 aa  463  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.75 
 
 
476 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.19 
 
 
476 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  52.15 
 
 
511 aa  456  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.69 
 
 
476 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 
476 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 
476 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.73 
 
 
476 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.12 
 
 
476 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 
476 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.69 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.16 
 
 
476 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.38 
 
 
473 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.63 
 
 
466 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.78 
 
 
470 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.92 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.18 
 
 
462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.1 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.97 
 
 
462 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  51.16 
 
 
468 aa  444  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 
496 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 
472 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
475 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.97 
 
 
462 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.65 
 
 
478 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.97 
 
 
462 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  51.4 
 
 
466 aa  441  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.42 
 
 
475 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.02 
 
 
463 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
475 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.78 
 
 
467 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
478 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 
478 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.4 
 
 
470 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
481 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 
478 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.21 
 
 
478 aa  435  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 
483 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.74 
 
 
478 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  51.18 
 
 
464 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.5 
 
 
466 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
478 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.05 
 
 
475 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.37 
 
 
598 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
474 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.46 
 
 
464 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  49.47 
 
 
478 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.47 
 
 
478 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.47 
 
 
478 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.22 
 
 
466 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
477 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.47 
 
 
478 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.47 
 
 
476 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 
478 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.48 
 
 
468 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.84 
 
 
474 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0800  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 
478 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0886  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.74 
 
 
478 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>