More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1454 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.34 
 
 
784 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  47.38 
 
 
781 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  46.94 
 
 
794 aa  681    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  49.35 
 
 
830 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  45.63 
 
 
799 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  48.44 
 
 
792 aa  666    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  44.91 
 
 
792 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  44.79 
 
 
839 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.36 
 
 
785 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  48.89 
 
 
793 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  48.43 
 
 
785 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  44.91 
 
 
797 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  51.25 
 
 
764 aa  692    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  47.96 
 
 
784 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  64.67 
 
 
804 aa  1004    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  45.57 
 
 
799 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.71 
 
 
818 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  45.32 
 
 
779 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47.92 
 
 
797 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.22 
 
 
787 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  47.65 
 
 
798 aa  697    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  47.78 
 
 
801 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  48.11 
 
 
802 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  46.34 
 
 
788 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  49.54 
 
 
777 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  47.08 
 
 
797 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  48.3 
 
 
797 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.29 
 
 
808 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  44.86 
 
 
856 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  48.02 
 
 
783 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  69.36 
 
 
800 aa  1064    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  45.51 
 
 
788 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  48.76 
 
 
777 aa  667    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  47.82 
 
 
787 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  44.91 
 
 
799 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.28 
 
 
787 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  47.85 
 
 
781 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  46.42 
 
 
788 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  48.28 
 
 
787 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  48.3 
 
 
799 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  48.08 
 
 
787 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.36 
 
 
816 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  47 
 
 
781 aa  643    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  48.04 
 
 
799 aa  688    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.17 
 
 
800 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  100 
 
 
772 aa  1573    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  47.53 
 
 
770 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47.95 
 
 
787 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  46.29 
 
 
788 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  64.46 
 
 
767 aa  941    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47.46 
 
 
779 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  71.93 
 
 
767 aa  1117    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  45.31 
 
 
799 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  49.8 
 
 
823 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  47.14 
 
 
799 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.48 
 
 
801 aa  681    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  48.96 
 
 
801 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  48.89 
 
 
828 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  45.52 
 
 
825 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  45.99 
 
 
782 aa  633  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  46.93 
 
 
779 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.74 
 
 
814 aa  631  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  43.92 
 
 
796 aa  626  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  45.52 
 
 
825 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.18 
 
 
779 aa  625  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  44.52 
 
 
784 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  45.76 
 
 
825 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.18 
 
 
793 aa  617  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  46.51 
 
 
812 aa  617  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  48.54 
 
 
787 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  48.67 
 
 
787 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  48.29 
 
 
787 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.67 
 
 
787 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.67 
 
 
787 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  48.54 
 
 
787 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  45.81 
 
 
784 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  48.54 
 
 
787 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  48.54 
 
 
787 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  45.68 
 
 
780 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  44.4 
 
 
788 aa  572  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  41.84 
 
 
1363 aa  556  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  40.03 
 
 
1350 aa  538  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  38.59 
 
 
769 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  36.24 
 
 
1387 aa  458  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  51.58 
 
 
812 aa  376  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.84 
 
 
754 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1732  xanthine dehydrogenase  29.93 
 
 
730 aa  306  7e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  30.32 
 
 
753 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  31.28 
 
 
782 aa  272  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3594  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.54 
 
 
774 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1446  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.2 
 
 
714 aa  259  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2681  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  26.93 
 
 
763 aa  250  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1504  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.05 
 
 
758 aa  250  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4003  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.94 
 
 
772 aa  249  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.567509  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4156  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  28.72 
 
 
765 aa  248  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0842  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  28.59 
 
 
765 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0826  Xanthine dehydrogenase  28.59 
 
 
765 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3191  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  28.59 
 
 
765 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02699  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit  28.78 
 
 
752 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3026  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  28.59 
 
 
765 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.214024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>