More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1440 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
331 aa  674    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  56.56 
 
 
324 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  45.22 
 
 
331 aa  249  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  36.74 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  33.01 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 
329 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 
321 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  36.22 
 
 
335 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 
321 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 
368 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
310 aa  152  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  33.23 
 
 
337 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  35.51 
 
 
348 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  34.27 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  33.02 
 
 
342 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  31.71 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  32.15 
 
 
361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  30.72 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  32.34 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 
384 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  31.21 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 
329 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 
325 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  30.36 
 
 
359 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
324 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  29.43 
 
 
359 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  27.79 
 
 
354 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
357 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  32.14 
 
 
362 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 
359 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.12 
 
 
346 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
323 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  27.13 
 
 
354 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 
359 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  29.43 
 
 
359 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  30.43 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  27.89 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  29.13 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  29.13 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.13 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  29.13 
 
 
359 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  29.13 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
359 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  28.06 
 
 
358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
322 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  29.73 
 
 
359 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  30.53 
 
 
328 aa  119  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
359 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 
351 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  28.83 
 
 
359 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  32.15 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 
357 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 
330 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  28.66 
 
 
326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.03 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  28.97 
 
 
331 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 
314 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  29.85 
 
 
366 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  30.41 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  29.79 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  26.4 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  28 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  30.62 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
350 aa  108  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
315 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
324 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  30 
 
 
317 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.75 
 
 
334 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 
349 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  30 
 
 
317 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
320 aa  105  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  29.06 
 
 
317 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 
345 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28.43 
 
 
334 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 
317 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 
354 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
317 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 
363 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
365 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  29.38 
 
 
317 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  29.38 
 
 
317 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  27.94 
 
 
317 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  29.03 
 
 
363 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 
400 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 
352 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
318 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>