More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1363 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  100 
 
 
402 aa  804    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  59.51 
 
 
414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  36.75 
 
 
444 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  32.8 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  32.98 
 
 
727 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  32.98 
 
 
727 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  33.33 
 
 
582 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  39.59 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  47.59 
 
 
375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  36.82 
 
 
448 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.03 
 
 
375 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  42.26 
 
 
375 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  33.02 
 
 
590 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  32.73 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  62.86 
 
 
523 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  52 
 
 
751 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  42.86 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  58.82 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  33.89 
 
 
271 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  33.89 
 
 
271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  33.33 
 
 
265 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  38.17 
 
 
450 aa  126  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  35.82 
 
 
445 aa  126  7e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  31.75 
 
 
271 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50.39 
 
 
379 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  62.75 
 
 
238 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  31.69 
 
 
539 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  38.61 
 
 
377 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  33.07 
 
 
419 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  37.38 
 
 
301 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  55.28 
 
 
229 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  31.17 
 
 
482 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  35.02 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.93 
 
 
274 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  52 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.21 
 
 
399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41.21 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  30.75 
 
 
320 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  31.39 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  30.56 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  51.59 
 
 
824 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.65 
 
 
283 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  57.26 
 
 
411 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  51.2 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  51.69 
 
 
301 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.08 
 
 
309 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  51.38 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  36.15 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  52.99 
 
 
491 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  31.92 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  33.73 
 
 
300 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  39.72 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  49.59 
 
 
230 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  32.89 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  50.4 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  32.44 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  44.24 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  40.4 
 
 
400 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  51.85 
 
 
431 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  33.33 
 
 
323 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  52 
 
 
195 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  29.75 
 
 
479 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  30.28 
 
 
314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  30.12 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  42.94 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  49.65 
 
 
216 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  50.4 
 
 
198 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  33.99 
 
 
294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  34.54 
 
 
292 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  40.35 
 
 
299 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  31.73 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  53.04 
 
 
469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  53.04 
 
 
469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  47.54 
 
 
269 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  38.24 
 
 
325 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  49.6 
 
 
198 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  46.83 
 
 
373 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  38.76 
 
 
374 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  44.81 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  28.96 
 
 
323 aa  112  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  48.92 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  51.2 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  34.14 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  31.49 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  50.41 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  35.48 
 
 
334 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  48.36 
 
 
687 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  50 
 
 
417 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  27.22 
 
 
453 aa  111  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  52.14 
 
 
303 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  54.08 
 
 
460 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  39.38 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  47.86 
 
 
247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  50 
 
 
316 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  30.12 
 
 
278 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  31.44 
 
 
273 aa  110  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  50 
 
 
233 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.39 
 
 
303 aa  109  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  38.55 
 
 
274 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  38.57 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>