More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1321 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
449 aa  910  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  84.15 
 
 
449 aa  786  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2409  phenylacetate-CoA ligase  59.46 
 
 
426 aa  538  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  52.58 
 
 
435 aa  481  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  51.79 
 
 
443 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  50.78 
 
 
435 aa  469  1e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  51.12 
 
 
434 aa  465  1e-130  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  52.94 
 
 
433 aa  466  1e-130  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  53.47 
 
 
433 aa  466  1e-130  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  50.68 
 
 
433 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  53.14 
 
 
442 aa  463  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  51.79 
 
 
433 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  52.01 
 
 
434 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  53.14 
 
 
444 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  52.39 
 
 
439 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  53.88 
 
 
443 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  50.9 
 
 
435 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  51.12 
 
 
432 aa  458  1e-128  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  49.44 
 
 
434 aa  461  1e-128  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  49.66 
 
 
434 aa  459  1e-128  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65841e-12 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  51.68 
 
 
435 aa  461  1e-128  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  52.97 
 
 
445 aa  459  1e-128  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  53.47 
 
 
432 aa  459  1e-128  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  51.12 
 
 
432 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  53.18 
 
 
434 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  52.02 
 
 
444 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  50.9 
 
 
432 aa  458  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  51.01 
 
 
434 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  53.65 
 
 
449 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  50.77 
 
 
435 aa  451  1e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  51.03 
 
 
436 aa  452  1e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  49.89 
 
 
433 aa  454  1e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  50.91 
 
 
432 aa  453  1e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  50.67 
 
 
444 aa  452  1e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  51.03 
 
 
433 aa  452  1e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  52.05 
 
 
434 aa  454  1e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  50.23 
 
 
433 aa  453  1e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  50.9 
 
 
444 aa  453  1e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  52.05 
 
 
434 aa  454  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  50.91 
 
 
442 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  51.35 
 
 
435 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.76262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  50.9 
 
 
432 aa  448  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  53.72 
 
 
444 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  52.47 
 
 
443 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  50.45 
 
 
440 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  50.89 
 
 
433 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  50.57 
 
 
441 aa  445  1e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  50.68 
 
 
440 aa  446  1e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  50.45 
 
 
440 aa  447  1e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6182  phenylacetate-CoA ligase  53.7 
 
 
435 aa  447  1e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  49.67 
 
 
436 aa  445  1e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  50.45 
 
 
440 aa  447  1e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  50.79 
 
 
437 aa  447  1e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  51.02 
 
 
434 aa  448  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  49.11 
 
 
433 aa  447  1e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  52.27 
 
 
444 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  51.12 
 
 
433 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
436 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  49.89 
 
 
434 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
440 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  49.89 
 
 
436 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  51.36 
 
 
444 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  49.89 
 
 
434 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  50.11 
 
 
440 aa  440  1e-122  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  50.68 
 
 
434 aa  439  1e-122  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  49.43 
 
 
448 aa  440  1e-122  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
440 aa  441  1e-122  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  52.28 
 
 
446 aa  440  1e-122  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  49.1 
 
 
446 aa  441  1e-122  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  48.65 
 
 
433 aa  440  1e-122  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  52.13 
 
 
432 aa  441  1e-122  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
434 aa  441  1e-122  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  50.79 
 
 
456 aa  441  1e-122  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  49.89 
 
 
433 aa  438  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  49.78 
 
 
441 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  50.57 
 
 
434 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
432 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  49.66 
 
 
434 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
432 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  48.64 
 
 
431 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  49.43 
 
 
439 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  51.37 
 
 
448 aa  435  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  50 
 
 
432 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  52 
 
 
445 aa  435  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  49.55 
 
 
432 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
434 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
432 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
432 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  50.34 
 
 
428 aa  432  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  49.33 
 
 
439 aa  433  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  49.66 
 
 
439 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  49.32 
 
 
432 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  51.85 
 
 
450 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  49.33 
 
 
439 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  51.14 
 
 
427 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  50.79 
 
 
441 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  48.21 
 
 
439 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
432 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  49.77 
 
 
437 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2034  phenylacetate-CoA ligase  51.14 
 
 
437 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0258334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>