27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1320 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  100 
 
 		 144 aa  300  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  81.29 
 
 		 147 aa  236  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  57.14 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  45.14 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  47.24 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  29.69 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  31.11 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  29.6 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  25.41 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  26.06 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  34.41 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  27.21 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  33.33 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  32.89 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  33.03 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  29 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  31.53 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  22.46 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>