71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1294 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  100 
 
 
340 aa  693    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  73.53 
 
 
346 aa  505  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  42.53 
 
 
368 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  34.89 
 
 
363 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  34.9 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  30.89 
 
 
360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  32.13 
 
 
354 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  29.85 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  31.5 
 
 
354 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  29.82 
 
 
366 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  28.36 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  31.61 
 
 
370 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  33.55 
 
 
337 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  30.09 
 
 
366 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  28.83 
 
 
342 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  27.05 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  35.03 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  26.61 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  28.57 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  23.08 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  24.05 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  26.69 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  25.28 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  22.7 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  26.75 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  24.77 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  29.07 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  28.07 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  25.51 
 
 
323 aa  62.8  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  28.63 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  24.76 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  25.08 
 
 
357 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.4 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  24.63 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  27.49 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.19 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  25.16 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  26.29 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1112  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  25.35 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  30.17 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  31.13 
 
 
417 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  29.05 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  33.96 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  34.12 
 
 
410 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  36.36 
 
 
419 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  36.36 
 
 
419 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  22.82 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  29.05 
 
 
346 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  24.19 
 
 
421 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  24.19 
 
 
421 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  33.72 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0509  beta-lactam resistance factor  25.1 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.695705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  28 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  25.31 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  28.21 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  23.74 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  27.53 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0510  murM protein, putative  35.96 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  25.48 
 
 
344 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0386  peptidoglycan branched peptide synthesis protein  28.28 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  23.42 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  25.11 
 
 
416 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.5 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  25.7 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0946  femA protein  23.97 
 
 
417 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.70677  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  21.5 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  30.69 
 
 
445 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  30.69 
 
 
445 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.48 
 
 
344 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  25.29 
 
 
366 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0886  Methicillin resistance protein  30.12 
 
 
437 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>