More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1278 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  34.22 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  34.22 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  30.72 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  31.13 
 
 		 319 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  31.13 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  29.68 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  32.37 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  35.74 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  29.81 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.06 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  28.75 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.75 
 
 		 315 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.75 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  32.57 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.44 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.44 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.91 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.25 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  34.81 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  31.25 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  28.99 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  28.38 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2533  PfkB domain protein  30.17 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  32.78 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  35.27 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2598  PfkB  31.05 
 
 		 382 aa  99.8  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.098069  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  31.41 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  34.43 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  28.8 
 
 		 349 aa  95.9  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  30.13 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  34.18 
 
 		 297 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  32.36 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.75 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  29.76 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  31.21 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  31.67 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  27.54 
 
 		 642 aa  89.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  25.47 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  31.8 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  27.5 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  29.14 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  31.7 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  31.71 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  30.37 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  32.46 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  30.2 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  28.06 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  30.29 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  29.79 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  34.55 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  28.87 
 
 		 310 aa  85.9  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  29.01 
 
 		 331 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  22.82 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  28.85 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  32.59 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  28.76 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.4 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  29.78 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  31.87 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  30.29 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  32.73 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  24.84 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  28.36 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  32.96 
 
 		 823 aa  82.8  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.77 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  29.02 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  24.31 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  29.02 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  29.68 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  24.2 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  31.88 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  29.02 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  25 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  25.71 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  27.87 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  25.25 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  31.08 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.33 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  28.27 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>