More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1276 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
281 aa  560  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  49.65 
 
 
287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47 
 
 
286 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.97 
 
 
283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.92 
 
 
308 aa  244  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.77 
 
 
284 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.31 
 
 
284 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.01 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.01 
 
 
284 aa  238  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  43.32 
 
 
307 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
285 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.58 
 
 
313 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  39.93 
 
 
284 aa  231  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  42.46 
 
 
285 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.14 
 
 
284 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
285 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
285 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
285 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
285 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
285 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
285 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
285 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.58 
 
 
313 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.3 
 
 
305 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
285 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  42.46 
 
 
285 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  42.11 
 
 
287 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  40.7 
 
 
286 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  40.7 
 
 
286 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  41.05 
 
 
308 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  40.7 
 
 
287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  40.7 
 
 
286 aa  224  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  45.77 
 
 
284 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  44.21 
 
 
288 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  41.37 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.1 
 
 
312 aa  219  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.26 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  41.22 
 
 
281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.79 
 
 
288 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.669513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.79 
 
 
288 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.626031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  41.22 
 
 
281 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  41.84 
 
 
284 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  41.02 
 
 
293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.32 
 
 
288 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328122  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.26 
 
 
309 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  41.2 
 
 
284 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  41.2 
 
 
284 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0127  fructose-bisphosphate aldolase  40.68 
 
 
293 aa  210  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000349017  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  41.2 
 
 
284 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  41.2 
 
 
284 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  41.2 
 
 
284 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  41.2 
 
 
284 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  39.93 
 
 
287 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  41.2 
 
 
284 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  40.85 
 
 
284 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  40.85 
 
 
284 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.83 
 
 
311 aa  208  7e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  39.22 
 
 
284 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  39.22 
 
 
284 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  39.22 
 
 
284 aa  208  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.41 
 
 
297 aa  208  9e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  40.99 
 
 
330 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  40.99 
 
 
284 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  38.19 
 
 
309 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  40.99 
 
 
330 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  40.99 
 
 
330 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  38.87 
 
 
292 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  40.07 
 
 
283 aa  207  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.51 
 
 
330 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  40.99 
 
 
330 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  37.23 
 
 
283 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
286 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0323  hypothetical protein  39.79 
 
 
287 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  38.59 
 
 
323 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  37.46 
 
 
286 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  37.46 
 
 
286 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  37.46 
 
 
286 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
286 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  38.08 
 
 
283 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
286 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
286 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  37.46 
 
 
286 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  41.13 
 
 
295 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  36.75 
 
 
292 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  37.86 
 
 
283 aa  202  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.6 
 
 
307 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl644  fructose-biphosphate aldolase  38.7 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  38.73 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  39.22 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0331  hypothetical protein  39.08 
 
 
286 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.220687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  40.21 
 
 
286 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2168  fructose-bisphosphate aldolase  38.67 
 
 
298 aa  198  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00424601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  36.16 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  41.23 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  38.03 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  38.46 
 
 
285 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.93 
 
 
307 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  41.45 
 
 
281 aa  194  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  38.1 
 
 
285 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2255  ketose-bisphosphate aldolase  39.86 
 
 
280 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000023078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>