142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1241 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  100 
 
 		 101 aa  203  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0929  DNA polymerase beta domain protein region  45.83 
 
 		 96 aa  92.8  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.887181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  47.42 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1320  DNA polymerase, beta-like region  44.21 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1207  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  43.75 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3203  DNA polymerase beta subunit  43.16 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  46.99 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2495  DNA polymerase beta domain protein region  37.36 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  41.33 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  39.33 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  41.76 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2462  DNA polymerase beta subunit  38.3 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  38.75 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  34.02 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  40.23 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  45.45 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  37.5 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  39.8 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  35.05 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  38.1 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  38.16 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  41.89 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.57 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  37.21 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  40.74 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  53.85 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  43.33 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  43.33 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  45.31 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1102  hypothetical protein  34.83 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.836571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  37.97 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  43.55 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  32.18 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0146  nucleotidyltransferase family protein  30.56 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0363177  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0587  DNA polymerase, beta-like region  45.83 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  37.33 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1518  DNA polymerase beta domain protein region  29.47 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  40.51 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  41.82 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  32.91 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  42.42 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  32.04 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  37.08 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  32.67 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  37.18 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  32.99 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  39.33 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  43.1 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  38.3 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  38.75 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  32.91 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  37 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  31.68 
 
 		 103 aa  48.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  37.23 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  35.29 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  48.15 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  36.49 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3539  DNA polymerase, beta-like region  36.14 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418484  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  70.59 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  41.94 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  36.23 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1292  DNA polymerase beta domain protein region  44.79 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.114397  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  30.69 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  35.9 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  32.95 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  40.26 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  31.17 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  38.96 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  34.57 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  40.54 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  30.93 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  30.93 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  41.98 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  34.83 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  41.67 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0315  DNA polymerase beta domain protein region  33.67 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0889475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  32.86 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  38.46 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4420  DNA polymerase beta subunit  39.19 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478946  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  36.99 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0410  DNA polymerase beta domain protein region  40.32 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  30.11 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>