81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1240 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1240  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0899375  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3202  hypothetical protein  44.35 
 
 
127 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.317376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0016  hypothetical protein  46.77 
 
 
124 aa  120  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1208  protein of unknown function DUF86  44.26 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0930  protein of unknown function DUF86  45.08 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.922217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1519  protein of unknown function DUF86  36.21 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.2684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0295  protein of unknown function DUF86  36.59 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.603584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0370  hypothetical protein  34.95 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.823692  normal  0.271446 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0505  hypothetical protein  26.19 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0868  protein of unknown function DUF86  26.19 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1165  hypothetical protein  41.67 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3785  protein of unknown function DUF86  29.84 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.129087  normal  0.515713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3136  protein of unknown function DUF86  34.51 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.29369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2973  protein of unknown function DUF86  34.51 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1112  hypothetical protein  35.4 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.952471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2463  hypothetical protein  34.18 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227725  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3118  hypothetical protein  31.53 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3483  protein of unknown function DUF86  30.43 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0548  hypothetical protein  32.43 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2071  protein of unknown function DUF86  30.77 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012332  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2705  hypothetical protein  31.53 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0034  protein of unknown function DUF86  38.57 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.225981  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2451  hypothetical protein  34.44 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000252259  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3558  hypothetical protein  32 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107769  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1765  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1804  protein of unknown function DUF86  27.35 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4166  hypothetical protein  34.58 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1076  protein of unknown function DUF86  33.03 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.814498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50240  hypothetical protein  30.17 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.753692  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1695  hypothetical protein  30.83 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.398533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0032  hypothetical protein  30.21 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.89444  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5819  protein of unknown function DUF86  29.91 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2423  hypothetical protein  32.14 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1880  protein of unknown function DUF86  29.46 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1854  protein of unknown function DUF86  29.46 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1729  hypothetical protein  35.14 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.993735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0089  hypothetical protein  37.31 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1653  hypothetical protein  28.95 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.12899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3744  protein of unknown function DUF86  36.23 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0018  ISSod9 hypothetical protein  37.18 
 
 
125 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.231151  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0169  ISSod9 hypothetical protein  37.18 
 
 
125 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.194296  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2287  hypothetical protein  31.91 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3298  protein of unknown function DUF86  25.89 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1202  protein of unknown function DUF86  29.91 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2149  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1407  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1813  hypothetical protein  30.56 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.691748  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2758  hypothetical protein  37.29 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0549  hypothetical protein  26.67 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2871  protein of unknown function DUF86  31.96 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  0.932974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3038  protein of unknown function DUF86  37.93 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0846  hypothetical protein  32.41 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0373  hypothetical protein  34.18 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.368479  normal  0.363257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1037  protein of unknown function DUF86  30.09 
 
 
110 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0341749  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1369  hypothetical protein  28.07 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.150444  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2496  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0885  hypothetical protein  29.35 
 
 
113 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.152206  hitchhiker  0.00000000727244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3689  hypothetical protein  25.47 
 
 
114 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.119376  hitchhiker  0.00953852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2367  hypothetical protein  29.52 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.855839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2494  hypothetical protein  27 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1805  protein of unknown function DUF86  31.08 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1341  protein of unknown function DUF86  30 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1229  hypothetical protein  35.58 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.949454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0685  hypothetical protein  26.26 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0153  hypothetical protein  28.95 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0899  hypothetical protein  27.03 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84236  unclonable  0.000014673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2671  hypothetical protein  28.18 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.850866  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5351  hypothetical protein  31.08 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3261  protein of unknown function DUF86  39.02 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  26.36 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1969  hypothetical protein  28.05 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  27.73 
 
 
208 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1202  hypothetical protein  26.32 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0520235  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  27.73 
 
 
208 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0257  protein of unknown function DUF86  30.59 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2533  hypothetical protein  26.53 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0126172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0997  protein of unknown function DUF86  30.99 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0512778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0358  hypothetical protein  28.97 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0604  hypothetical protein  30.3 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0480  hypothetical protein  32.14 
 
 
116 aa  40  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0275  hypothetical protein  32.79 
 
 
110 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>