More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1218 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 173 aa  355  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  78.26 
 
 		 174 aa  266  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  56.91 
 
 		 204 aa  193  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  55.41 
 
 		 238 aa  187  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  55.41 
 
 		 225 aa  184  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  55.41 
 
 		 252 aa  184  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  54.19 
 
 		 197 aa  184  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  52.1 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  49.44 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  52.26 
 
 		 174 aa  177  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  51.83 
 
 		 168 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  52.53 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  51.95 
 
 		 202 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 227 aa  174  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  52.26 
 
 		 173 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  52.17 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  52.6 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  53.55 
 
 		 182 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  49.04 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  53.16 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  54.19 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  51.83 
 
 		 238 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  51.83 
 
 		 238 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  51.22 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  51.83 
 
 		 238 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  52.26 
 
 		 173 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  55.26 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 357 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  51.61 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  51.3 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  48.39 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  51.61 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  52.29 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  51.61 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  51.28 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  52.29 
 
 		 212 aa  168  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  53.02 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  51.32 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  51.28 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  51.97 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  49.67 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  48.12 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  51.3 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 171 aa  164  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  46.78 
 
 		 193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  56.86 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  51.68 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  54 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  49.35 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  49.02 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  49.36 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  49.04 
 
 		 173 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 277 aa  161  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 204 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  48.08 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  52.26 
 
 		 194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  47.13 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  52.26 
 
 		 194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  50.65 
 
 		 204 aa  160  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 178 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  47.9 
 
 		 182 aa  160  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  44.87 
 
 		 170 aa  160  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  51.97 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 146 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  50.97 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  52.52 
 
 		 145 aa  160  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 195 aa  160  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  49.67 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  47.06 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  48.08 
 
 		 415 aa  159  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  47.4 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  47.1 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  47.4 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  46.78 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  53.96 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  48.05 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  49.03 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  51.97 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  47.06 
 
 		 177 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>