More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1185 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
447 aa  910  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  6.45588e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2692  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  67.33 
 
 
450 aa  628  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0719706  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  38.6 
 
 
451 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 
464 aa  346  6e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  37.58 
 
 
515 aa  342  9e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  38.26 
 
 
464 aa  336  4e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.89 
 
 
465 aa  336  6e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 
465 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  40.84 
 
 
535 aa  332  7e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  40.99 
 
 
485 aa  328  1e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  37.23 
 
 
465 aa  325  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 
462 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  39.78 
 
 
462 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.04 
 
 
544 aa  323  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.2 
 
 
467 aa  320  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 
536 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.69 
 
 
460 aa  314  2e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 
536 aa  314  2e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 
524 aa  313  5e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 
535 aa  309  6e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 
476 aa  309  7e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39 
 
 
455 aa  308  2e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  41.26 
 
 
460 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  41.48 
 
 
460 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  42.23 
 
 
461 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 
463 aa  305  7e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  38.41 
 
 
469 aa  305  1e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  38.44 
 
 
536 aa  305  1e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  40.3 
 
 
464 aa  304  2e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  36.21 
 
 
570 aa  303  3e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.07 
 
 
466 aa  303  6e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  39.2 
 
 
467 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  38.71 
 
 
531 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  38.7 
 
 
465 aa  300  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.5 
 
 
540 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41 
 
 
469 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.59 
 
 
543 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.61 
 
 
471 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  38.34 
 
 
462 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  38.76 
 
 
484 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
525 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
470 aa  295  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  38.6 
 
 
489 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  41.88 
 
 
467 aa  295  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.15978e-10 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 
547 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.64 
 
 
490 aa  293  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  39.34 
 
 
467 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  39.56 
 
 
467 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  37.05 
 
 
467 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  37.22 
 
 
464 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  39.82 
 
 
468 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  37.95 
 
 
462 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.73 
 
 
474 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  36.36 
 
 
469 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.09 
 
 
470 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  37.19 
 
 
465 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  36.47 
 
 
468 aa  286  5e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.94 
 
 
466 aa  286  6e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.26 
 
 
481 aa  285  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.73 
 
 
541 aa  285  1e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.69 
 
 
530 aa  284  3e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  34.56 
 
 
522 aa  282  8e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 
468 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.08 
 
 
490 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  3.50398e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.77 
 
 
468 aa  282  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 
468 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
470 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  36.91 
 
 
452 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  36.73 
 
 
480 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.96 
 
 
536 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 
478 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37 
 
 
464 aa  276  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  37.39 
 
 
478 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  35.97 
 
 
452 aa  276  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  36.93 
 
 
455 aa  276  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.17 
 
 
480 aa  276  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  37.17 
 
 
480 aa  276  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  33.92 
 
 
470 aa  275  1e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  36.83 
 
 
478 aa  274  2e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.28 
 
 
480 aa  275  2e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  35.46 
 
 
466 aa  274  2e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  37.16 
 
 
465 aa  274  2e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  38.55 
 
 
468 aa  273  4e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.06 
 
 
480 aa  273  4e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 
454 aa  273  5e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  37.41 
 
 
459 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 
467 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  35.7 
 
 
472 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  36.43 
 
 
453 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.84 
 
 
480 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  35.15 
 
 
455 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  37.41 
 
 
472 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  37.41 
 
 
472 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  37.41 
 
 
472 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  37.19 
 
 
472 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  37.19 
 
 
603 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  37.7 
 
 
452 aa  270  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 
453 aa  269  6e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 
542 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  35.84 
 
 
454 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>