More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1170 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  74.1 
 
 		 305 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  50.99 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  32.43 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.53 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  27.51 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  29.58 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 315 aa  99.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  30.37 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  31.54 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  29.14 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  31.97 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  27.42 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  30.5 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30.54 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  27.99 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  24.32 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  30.23 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  28.21 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  26.64 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  29.15 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  31.79 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.37 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  25.82 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.82 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  27.92 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  26.28 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.79 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  25.75 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  28.08 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.82 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  27.15 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.82 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  26.92 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.82 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.01 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  27.5 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  29.55 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.49 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  27.92 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.91 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25.45 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  28.52 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.45 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1072  PfkB  31.85 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  28.52 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  25.94 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  27.03 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  27.39 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  27.39 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  23.81 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  29.69 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  26.9 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  25.51 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  26.72 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  26.35 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  27.01 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  26.52 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.02 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  27.33 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  26.58 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  27.71 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  27.09 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.37 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  30.85 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  26.59 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  25.33 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  25.33 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  27.34 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  25.33 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  27.07 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  25.33 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  24.83 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  24.58 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.96 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  25.33 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  24.55 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  25.71 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  26.59 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  27.36 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  26.69 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.83 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  25.25 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.62 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  24.5 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  24.83 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  25.56 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  30.23 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  26.28 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  27.15 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  25.48 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25.58 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  25.45 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  26.07 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>