More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1144 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
398 aa  780  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00903632  normal  0.254624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.65 
 
 
332 aa  285  1e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00733957  hitchhiker  0.00049009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
334 aa  185  1e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
332 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
334 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 
333 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  31.16 
 
 
339 aa  175  1e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
321 aa  174  2e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.61 
 
 
332 aa  174  3e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66552  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  30.15 
 
 
339 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  30.15 
 
 
339 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  31.08 
 
 
339 aa  172  7e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
332 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483809  normal  0.155681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  31.16 
 
 
339 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5699  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  29.6 
 
 
327 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0252968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  30.08 
 
 
351 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  31.58 
 
 
339 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  30.65 
 
 
339 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  30.9 
 
 
339 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
329 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
321 aa  167  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  30.4 
 
 
339 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  30.4 
 
 
339 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  30.4 
 
 
339 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  30.4 
 
 
339 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  30.15 
 
 
381 aa  166  7e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  30.15 
 
 
339 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  30.15 
 
 
339 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  30.15 
 
 
339 aa  166  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  30.15 
 
 
339 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  30.15 
 
 
339 aa  166  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  30.15 
 
 
339 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  30.15 
 
 
339 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  30.15 
 
 
339 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3964  hypothetical protein  31 
 
 
335 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
322 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.161485  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
326 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.545551 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
345 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.81 
 
 
345 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
339 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
321 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5350  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  29.55 
 
 
359 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
321 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.49 
 
 
349 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  2.68959e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.49 
 
 
349 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
477 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00974378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
334 aa  137  3e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.64 
 
 
460 aa  137  3e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00434596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.62 
 
 
353 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.92 
 
 
321 aa  137  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  50.36 
 
 
321 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  50.36 
 
 
321 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
326 aa  135  2e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00111488  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  48.18 
 
 
348 aa  134  4e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.24 
 
 
345 aa  133  7e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.242543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
345 aa  132  1e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  7.06294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
327 aa  132  1e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
321 aa  132  1e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
345 aa  132  1e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  4.6996e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
345 aa  131  2e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
327 aa  131  2e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.772391  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
343 aa  130  5e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.26602e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
334 aa  130  5e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.91 
 
 
345 aa  130  5e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.1 
 
 
360 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.111375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
315 aa  129  1e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
358 aa  129  1e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0891876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.3 
 
 
328 aa  129  1e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.111848  normal  0.36544 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
328 aa  129  1e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
322 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
331 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14290  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.74 
 
 
329 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
330 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  49.28 
 
 
324 aa  127  4e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.63 
 
 
321 aa  127  4e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.89 
 
 
321 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.89 
 
 
321 aa  127  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
327 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.4 
 
 
341 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445478  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.63 
 
 
321 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01740  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.5 
 
 
334 aa  126  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.89 
 
 
321 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  48.63 
 
 
326 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.95 
 
 
319 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.52 
 
 
326 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
328 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00209232  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
327 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  3.70081e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.83 
 
 
400 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71017  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
318 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
328 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.0366433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.18 
 
 
339 aa  123  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
326 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0206  oligopeptide ABC transporter, permease  39.31 
 
 
318 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.41 
 
 
400 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543295  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
335 aa  123  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  48.15 
 
 
321 aa  123  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
328 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0232  oligopeptide ABC transporter permease protein  46.72 
 
 
318 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.81 
 
 
325 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0210  oligopeptide ABC transporter, permease  46.72 
 
 
318 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>