More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1143 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  80.07 
 
 
577 aa  968  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
577 aa  1176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 
580 aa  319  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.07469e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 
638 aa  319  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
578 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 
578 aa  285  1e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
579 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  32.01 
 
 
587 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 
594 aa  276  8e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
579 aa  276  8e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  32.2 
 
 
607 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 
607 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  32.18 
 
 
581 aa  259  8e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
595 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  30.84 
 
 
584 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 
587 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 
591 aa  250  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
584 aa  223  1e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  29.8 
 
 
573 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  28.88 
 
 
589 aa  217  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 
589 aa  216  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  28.47 
 
 
587 aa  212  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  29.26 
 
 
540 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.37 
 
 
538 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 
578 aa  184  4e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 
534 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
533 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
538 aa  176  1e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
540 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 
622 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
565 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 
539 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.25789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 
576 aa  167  7e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.81 
 
 
546 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  7.75897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
551 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
619 aa  157  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  29.15 
 
 
520 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
559 aa  149  2e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.4 
 
 
524 aa  148  2e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
618 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
544 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
534 aa  142  1e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2546  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
531 aa  136  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145645  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 
510 aa  135  1e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 
508 aa  135  2e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 
557 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.69 
 
 
531 aa  133  1e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  26.62 
 
 
524 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  27.32 
 
 
537 aa  129  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.06 
 
 
528 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.07652e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.88 
 
 
528 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  8.13115e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.88 
 
 
528 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.78589e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.7 
 
 
528 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 
528 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.34 
 
 
529 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.37 
 
 
528 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.76887e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.2 
 
 
528 aa  127  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  25.33 
 
 
563 aa  127  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
529 aa  127  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.65149e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 
575 aa  126  8e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.34 
 
 
529 aa  127  8e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
536 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.56 
 
 
532 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.61 
 
 
567 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.22 
 
 
541 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.66118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  23.82 
 
 
566 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
544 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
567 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 
573 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  25.18 
 
 
527 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  26.12 
 
 
622 aa  123  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  23.77 
 
 
575 aa  123  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  25.59 
 
 
529 aa  122  2e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  26.3 
 
 
510 aa  121  4e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.67 
 
 
556 aa  120  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
655 aa  120  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 
640 aa  120  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
512 aa  120  1e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 
505 aa  119  1e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.84 
 
 
542 aa  119  2e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 
509 aa  119  2e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.65 
 
 
544 aa  118  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 
575 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 
526 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.13 
 
 
532 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.72 
 
 
539 aa  117  4e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.5 
 
 
575 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
657 aa  117  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5671  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
531 aa  117  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.880059  normal  0.0905991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.99 
 
 
524 aa  117  7e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3968  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
537 aa  117  7e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  23.72 
 
 
575 aa  116  9e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 
541 aa  115  2e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  23.61 
 
 
575 aa  115  2e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  23.32 
 
 
575 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.41 
 
 
575 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.32 
 
 
555 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 
607 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.61 
 
 
592 aa  114  4e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  25.53 
 
 
528 aa  114  4e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0778602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>