More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1126 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  758    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1085  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  84.18 
 
 
373 aa  658    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.863384  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  59.79 
 
 
392 aa  442  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.21 
 
 
376 aa  358  9e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  50.67 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.66 
 
 
377 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  50.13 
 
 
381 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
376 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
376 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  50.13 
 
 
381 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.13 
 
 
376 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.86 
 
 
375 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
381 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 
376 aa  349  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
376 aa  348  9e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
376 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  49.6 
 
 
376 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.33 
 
 
375 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.47 
 
 
379 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
377 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 
377 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.06 
 
 
375 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.39 
 
 
377 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.39 
 
 
377 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.19 
 
 
377 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  47.2 
 
 
379 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  47.2 
 
 
379 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.19 
 
 
377 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.19 
 
 
377 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.33 
 
 
375 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  46.67 
 
 
380 aa  345  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.87 
 
 
389 aa  343  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.8 
 
 
377 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  48.66 
 
 
377 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.33 
 
 
376 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  47.47 
 
 
379 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.77 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.33 
 
 
375 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  48.12 
 
 
377 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.18 
 
 
379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.49 
 
 
380 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.31 
 
 
377 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  46.52 
 
 
375 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4185  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.52 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.28 
 
 
380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  48.26 
 
 
378 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.06 
 
 
376 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.06 
 
 
375 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  48.13 
 
 
375 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  44.8 
 
 
379 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3574  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.39 
 
 
377 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31540  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.54 
 
 
375 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.430124  hitchhiker  0.000095284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.13 
 
 
379 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1555  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.92 
 
 
383 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.18 
 
 
379 aa  333  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  48.66 
 
 
377 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  45.45 
 
 
378 aa  332  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.06 
 
 
377 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.95 
 
 
375 aa  332  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  47.86 
 
 
375 aa  331  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3838  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.45 
 
 
376 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.03 
 
 
380 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.99 
 
 
376 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.13 
 
 
394 aa  329  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5985  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.72 
 
 
376 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48 
 
 
379 aa  329  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.27 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.85 
 
 
383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.27 
 
 
375 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.19 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3774  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.19 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2548  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.72 
 
 
375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48 
 
 
380 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.85 
 
 
383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3106  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.99 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.73 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.76 
 
 
380 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.2 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.26 
 
 
376 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.52 
 
 
376 aa  325  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.98 
 
 
377 aa  325  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  44.92 
 
 
379 aa  325  8.000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.87 
 
 
379 aa  325  9e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.75 
 
 
641 aa  324  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  46.49 
 
 
380 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05570  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  48.12 
 
 
377 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.213032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.33 
 
 
382 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.13 
 
 
376 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.03 
 
 
381 aa  323  4e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.01 
 
 
380 aa  322  6e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0140  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  46.79 
 
 
376 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.14 
 
 
379 aa  322  7e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.52 
 
 
380 aa  322  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  46.4 
 
 
381 aa  322  8e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  46.4 
 
 
381 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  46.4 
 
 
381 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  46.4 
 
 
381 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  46.4 
 
 
381 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  46.4 
 
 
381 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4666  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.4 
 
 
375 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  0.395379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>