More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1118 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  75.25 
 
 
397 aa  636  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
400 aa  810  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  7.04817e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  54.62 
 
 
393 aa  407  1e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  39.61 
 
 
392 aa  254  2e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  39.61 
 
 
392 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.1003e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  37.71 
 
 
397 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 
391 aa  240  3e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
391 aa  239  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.98035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
390 aa  221  2e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
395 aa  221  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  7.29506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  35.13 
 
 
398 aa  216  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  33.61 
 
 
401 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  32.04 
 
 
424 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
400 aa  201  2e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  1.72655e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  31.91 
 
 
401 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  6.02333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
413 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  5.95288e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 
415 aa  186  7e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
408 aa  186  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  31.68 
 
 
432 aa  184  2e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  33.07 
 
 
409 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  32.67 
 
 
419 aa  182  9e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.83609e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  31.78 
 
 
408 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  32.01 
 
 
425 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2174  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 
410 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.128166  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  34.54 
 
 
395 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2162  extracellular solute-binding protein family 1  32.8 
 
 
415 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.183799  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 
419 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  31.27 
 
 
408 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3841  extracellular solute-binding protein  32.87 
 
 
419 aa  174  2e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.3033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 
406 aa  174  3e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.03753e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3077  extracellular solute-binding protein family 1  32.89 
 
 
417 aa  173  4e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4064  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein, putative  33.43 
 
 
419 aa  173  6e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0421403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  32.6 
 
 
419 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  32.6 
 
 
419 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  32.6 
 
 
419 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.7749e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  32.6 
 
 
419 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  33.15 
 
 
419 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.42287e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  32.27 
 
 
419 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  33.15 
 
 
419 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13860  maltose-binding periplasmic protein  29.54 
 
 
412 aa  165  2e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 
411 aa  165  2e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 
410 aa  164  2e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3883  maltose/maltodextrin ABC transporter periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  30.26 
 
 
411 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.265603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 
410 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0914  maltose/maltodextrin ABC transporter, periplasmic maltose/maltodextrin-binding protein  30.26 
 
 
411 aa  163  4e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.459005  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1485  extracellular solute-binding protein family 1  33.88 
 
 
424 aa  163  5e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
432 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.19 
 
 
416 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1781  extracellular solute-binding protein family 1  34.37 
 
 
413 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
418 aa  155  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.72 
 
 
416 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  29.46 
 
 
392 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  30.58 
 
 
411 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  30.55 
 
 
403 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  30.55 
 
 
403 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  30.55 
 
 
403 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
423 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
423 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  30.79 
 
 
396 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1527  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 
412 aa  148  1e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.95 
 
 
397 aa  147  2e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1276  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
417 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000485827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0694  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 
415 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.29 
 
 
406 aa  146  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  32.7 
 
 
400 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
439 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.3 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.3 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.3 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.3 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.3 
 
 
396 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.57 
 
 
396 aa  141  2e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.57 
 
 
396 aa  141  2e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 
396 aa  141  2e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.57 
 
 
396 aa  141  2e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  29.57 
 
 
396 aa  141  2e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.57 
 
 
396 aa  141  2e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.57 
 
 
396 aa  141  2e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 
454 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5891  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 
402 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403986 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  29.3 
 
 
396 aa  139  8e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22450  maltose-binding periplasmic protein  28.5 
 
 
439 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.326435  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2152  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
415 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.410183  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  28.3 
 
 
467 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 
400 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
400 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.92 
 
 
400 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.33 
 
 
422 aa  128  1e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3696  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 
546 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.772784  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
460 aa  126  8e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5856  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 
450 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
440 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.53431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0986  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 
449 aa  122  1e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.265801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2649  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
400 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1151  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 
400 aa  120  4e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12290  maltose-binding periplasmic protein  26.57 
 
 
422 aa  120  5e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1853  maltose ABC transporter substrate binding protein  28.93 
 
 
409 aa  116  7e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2135  maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein MalE  26.98 
 
 
410 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
411 aa  109  8e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
414 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>