More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1100 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 159 aa  321  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  67.09 
 
 		 159 aa  216  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  45.28 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  45.83 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  40.25 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  38.85 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  42.67 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  40.54 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  40.88 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  39.24 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  35.22 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  36.48 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  35.85 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  38.99 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  35.85 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 175 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  36.25 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  37.74 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  39.19 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  37.34 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  41.43 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  37.75 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  37.97 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 155 aa  98.2  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 179 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  35.76 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1103  GreA/GreB family elongation factor  35.76 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000308289  normal  0.0184015 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  39.01 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  38.85 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6110  transcription elongation factor GreB  37.18 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  40.97 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  37.91 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  37.91 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  37.91 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  36.94 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  36.77 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  37.74 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  34.59 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  37.91 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>