More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1079 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 417 aa  844    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.97 
 
 		 417 aa  610  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.01 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.83 
 
 		 418 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.76 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.35 
 
 		 418 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.67 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.72 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.7 
 
 		 420 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.87 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.16 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.65 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.4 
 
 		 434 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.08 
 
 		 418 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.71 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.87 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.86 
 
 		 423 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.32 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.32 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.79 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.96 
 
 		 418 aa  421  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.82 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.6 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.85 
 
 		 421 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.72 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.08 
 
 		 419 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.46 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.97 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.56 
 
 		 421 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.1 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.23 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.77 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0612  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.7 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642668 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.8 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.1 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.27 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.66 
 
 		 419 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.99 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.39 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.1 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.24 
 
 		 419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.1 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.35 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.49 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.76 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.72 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.51 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.87 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.16 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.6 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.86 
 
 		 415 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.62 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.56 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.82 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.09 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.85 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.41 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.54 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.76 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.3 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.17 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.36 
 
 		 415 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.93 
 
 		 415 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.73 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.07 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>