126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1013 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1013  PKD domain-containing protein  100 
 
 
842 aa  1700  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000167268  normal  0.298358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 
535 aa  70.5  1e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0124  hypothetical protein  33.55 
 
 
737 aa  67  1e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.5 
 
 
517 aa  65.9  3e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  3.29781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  28.28 
 
 
399 aa  61.2  9e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
577 aa  59.7  2e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.71 
 
 
771 aa  59.3  3e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
558 aa  58.2  7e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1874  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.13 
 
 
474 aa  57.8  9e-07  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.96 
 
 
465 aa  57  1e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1190  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.31 
 
 
544 aa  57.4  1e-06  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.47 
 
 
425 aa  55.8  3e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.948372  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4164  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.09 
 
 
575 aa  55.8  3e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 
587 aa  56.2  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.17 
 
 
449 aa  55.8  3e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.09 
 
 
349 aa  55.8  3e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.54 
 
 
555 aa  54.7  7e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.1109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  32.89 
 
 
1150 aa  53.9  1e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2362  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.86 
 
 
666 aa  53.9  1e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814035  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  33.1 
 
 
1565 aa  53.1  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6261  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.34 
 
 
427 aa  53.1  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2269  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
461 aa  52.8  3e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.778693  normal  0.0483153 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.37 
 
 
298 aa  52.8  3e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.81 
 
 
658 aa  52.4  4e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239994  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  24.89 
 
 
576 aa  52.4  4e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2268  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
507 aa  52  5e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.0271027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  26.71 
 
 
298 aa  51.6  5e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 
413 aa  51.6  6e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.26 
 
 
487 aa  51.6  6e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.68 
 
 
617 aa  51.6  6e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.14 
 
 
636 aa  51.2  7e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1681  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.65 
 
 
444 aa  51.2  7e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.280538  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30600  subtilisin-like serine protease  29.15 
 
 
524 aa  51.2  8e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
375 aa  51.2  9e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
519 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.1 
 
 
415 aa  50.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.85 
 
 
639 aa  50.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  29.67 
 
 
497 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3748  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.08 
 
 
531 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.43 
 
 
423 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10331  hypothetical protein  24.79 
 
 
482 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.37 
 
 
653 aa  49.7  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.26 
 
 
911 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  2.89605e-05 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.88 
 
 
693 aa  49.7  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05587e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.33 
 
 
699 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2361  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.7 
 
 
563 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0874111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  28.19 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0995  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 
398 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4080  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 
549 aa  48.9  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.76 
 
 
396 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1292  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
913 aa  48.9  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.54 
 
 
1336 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  28.88 
 
 
533 aa  48.9  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0206  peptidase C1A papain  30.4 
 
 
797 aa  48.5  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.4 
 
 
625 aa  48.5  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  28.86 
 
 
497 aa  48.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.63 
 
 
453 aa  48.5  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  28.86 
 
 
500 aa  48.5  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  25.14 
 
 
397 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.52 
 
 
1217 aa  47.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1283  peptidase MprA  28.57 
 
 
550 aa  47.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8803  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 
464 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.33 
 
 
597 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5007  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.75 
 
 
554 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674675  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  27.8 
 
 
539 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  27.8 
 
 
563 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.59 
 
 
612 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.03 
 
 
442 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.883055  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  27.8 
 
 
563 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.75 
 
 
615 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  27.8 
 
 
539 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.07 
 
 
641 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0927  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.51 
 
 
795 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  27.8 
 
 
539 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  27.8 
 
 
539 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  27.8 
 
 
563 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2515  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.68 
 
 
401 aa  47.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160807  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  27.59 
 
 
641 aa  46.6  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1770  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.86 
 
 
527 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2753  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  55.56 
 
 
760 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.874894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  27.81 
 
 
1239 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.43 
 
 
1078 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.29 
 
 
552 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  24.86 
 
 
397 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  24.86 
 
 
397 aa  47  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  24.86 
 
 
397 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.25 
 
 
1085 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  28.09 
 
 
535 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5741  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.29 
 
 
552 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0530598  normal  0.287024 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  24.86 
 
 
397 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  24.86 
 
 
397 aa  47  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4563  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.29 
 
 
552 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  24.86 
 
 
397 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.8 
 
 
594 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0480  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.62 
 
 
431 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255354  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2098  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.86 
 
 
426 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 
540 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  29.44 
 
 
502 aa  45.8  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1224  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.61 
 
 
458 aa  45.8  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000763624 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  31.76 
 
 
586 aa  45.8  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>