More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0942 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  414  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 230 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  40.76 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  39.61 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  41.04 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  39.81 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  41.5 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  41.15 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  40.39 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  42.35 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 260 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 236 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  41.97 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  37.62 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  36.87 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  38.83 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  38.65 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 245 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  40.34 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>