More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0925 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 523 aa  1058    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  81.91 
 
 		 525 aa  874    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 		 546 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.9 
 
 		 550 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 		 529 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  34.27 
 
 		 547 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  34.09 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  34.28 
 
 		 538 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  34.26 
 
 		 543 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 529 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2713  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 529 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  33.66 
 
 		 532 aa  266  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2047  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 		 529 aa  264  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101703  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3829  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 		 569 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 564 aa  253  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 537 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 518 aa  249  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 		 531 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0799  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 531 aa  243  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162067  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1442  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.07 
 
 		 563 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2916  4-phytase  31.56 
 
 		 522 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 528 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 		 531 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3686  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 522 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3551  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, periplasmic dipeptide/oligopeptide/nickel-binding protein  32.39 
 
 		 522 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3198  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 547 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 535 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0197  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.05 
 
 		 535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.0839796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1105  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 522 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.2 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.2 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  33.2 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.2 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.2 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.2 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4056  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 489 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.2 
 
 		 533 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6301  extracellular solute-binding protein family 5  31.62 
 
 		 535 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4061  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 529 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.707761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0232  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 		 530 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79785  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1261  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2574  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1329  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1763  extracellular solute-binding protein family 5  32.62 
 
 		 536 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1065  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0504  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1427  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 		 533 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1410  solute-binding family 5 protein  32.16 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1258  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.81 
 
 		 543 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 529 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 529 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3741  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 533 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0553  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 522 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.727867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 533 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2056  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 521 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3777  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 533 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4591  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 533 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1253  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.27 
 
 		 533 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 538 aa  221  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  32.8 
 
 		 515 aa  220  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5714  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 533 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  31.63 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  30.87 
 
 		 531 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  32.95 
 
 		 536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  33.54 
 
 		 536 aa  213  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1799  extracellular solute-binding protein family 5  29.02 
 
 		 531 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0907769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  32.57 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.29 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1255  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 		 566 aa  207  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  29.16 
 
 		 538 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2911  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 524 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  29.13 
 
 		 528 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  28.49 
 
 		 528 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 556 aa  190  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.76 
 
 		 535 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 544 aa  183  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 536 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 538 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.04 
 
 		 516 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 536 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.85 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  29.04 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.04 
 
 		 516 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  27.66 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  27.66 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.66 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 544 aa  172  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 538 aa  170  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>