More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0924 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  100 
 
 
358 aa  670    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  65.59 
 
 
348 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.94 
 
 
386 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.05 
 
 
387 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.76 
 
 
387 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  34.38 
 
 
376 aa  189  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  36.39 
 
 
376 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  40.64 
 
 
379 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.83 
 
 
404 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  35.34 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  35.85 
 
 
389 aa  179  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  42.28 
 
 
376 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.3 
 
 
391 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  37.81 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  39.6 
 
 
382 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.73 
 
 
379 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.48 
 
 
393 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.65 
 
 
382 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.4 
 
 
352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  33.54 
 
 
383 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.55 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  31.27 
 
 
428 aa  126  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.64 
 
 
397 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.79 
 
 
392 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  31.71 
 
 
401 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  29.97 
 
 
393 aa  123  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.06 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  30.75 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  29.21 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  30.75 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  30.75 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.09 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.55 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.51 
 
 
396 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.51 
 
 
396 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.51 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  29.85 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  29.33 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  30.06 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  33.11 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  31.95 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  29.43 
 
 
385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  31.3 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  31.3 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  29.97 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  31.3 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.51 
 
 
390 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  30.64 
 
 
443 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.82 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  30.42 
 
 
412 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  27.39 
 
 
383 aa  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  30.5 
 
 
383 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  30 
 
 
428 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  29.53 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.24 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  30.21 
 
 
390 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  30.23 
 
 
403 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  29.75 
 
 
399 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  29.53 
 
 
430 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.28 
 
 
416 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  31.3 
 
 
401 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  30 
 
 
401 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  30.61 
 
 
401 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  30.09 
 
 
383 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  28.43 
 
 
408 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  30.54 
 
 
417 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  27.8 
 
 
408 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  30.65 
 
 
379 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  28.17 
 
 
393 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  31.2 
 
 
401 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  31.3 
 
 
401 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.51 
 
 
408 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.51 
 
 
408 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  28.37 
 
 
397 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  30.09 
 
 
449 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.61 
 
 
400 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  28.23 
 
 
378 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  29.77 
 
 
415 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  29.88 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  28.83 
 
 
393 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  28.2 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  25.72 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.9 
 
 
403 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  27.88 
 
 
380 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  29.61 
 
 
408 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  29.71 
 
 
402 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  27.13 
 
 
418 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  32.17 
 
 
401 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25.13 
 
 
420 aa  93.2  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  27.51 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  28.5 
 
 
393 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  28.49 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  26.74 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  28.95 
 
 
393 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  28.5 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  28.62 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  28.66 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  26.86 
 
 
418 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.15 
 
 
411 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.15 
 
 
411 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>