More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0898 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  226  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  54.7 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  51.14 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  34.31 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2369  ComG operon protein 3  32.93 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  48.21 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  48.21 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  36.7 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  38.24 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  34.25 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  45.61 
 
 
186 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  45.61 
 
 
186 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.45 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  35 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  48.15 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  36.7 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  32.81 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.94 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  46.67 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.46 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  33.68 
 
 
187 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  45.61 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.38 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  41.38 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  31.82 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  31.82 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  38.36 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  43.1 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  47.73 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  40.32 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  41.38 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  29.58 
 
 
99 aa  48.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  62.79 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  37.93 
 
 
221 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  40.32 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  39.76 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  48.28 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.76 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.27 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  40 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  56.41 
 
 
231 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.49 
 
 
175 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.14 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.14 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.13 
 
 
169 aa  47  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.82 
 
 
145 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.77 
 
 
157 aa  47  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  46.55 
 
 
155 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  61.11 
 
 
325 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  61.11 
 
 
323 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  44.44 
 
 
330 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  86.21 
 
 
148 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  36.9 
 
 
162 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  44.07 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  47.5 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.19 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2094  hypothetical protein  36.84 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.548773  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  57.14 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.54 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.27 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  33.33 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.91 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2448  hypothetical protein  62.5 
 
 
186 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.81 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  34.21 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  60 
 
 
313 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.62 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  33.33 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  53.7 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  26.76 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  80.77 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  50 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  30.48 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  26.76 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  45 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  45.76 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  39.13 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  39.66 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  45 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4141  hypothetical protein  39.62 
 
 
194 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  43.14 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4262  comG operon protein 3  28.57 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  45 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  45 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3594  hypothetical protein  43.33 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  42.37 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  35.24 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>